More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1278 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.32 
 
 		 685 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 694 aa  1427    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.38 
 
 		 779 aa  636    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.57 
 
 		 681 aa  700    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.16 
 
 		 689 aa  859    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.78 
 
 		 683 aa  663    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.11 
 
 		 679 aa  674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.06 
 
 		 685 aa  625  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.95 
 
 		 786 aa  621  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.92 
 
 		 692 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.9 
 
 		 680 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.16 
 
 		 678 aa  598  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.95 
 
 		 776 aa  598  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 		 682 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.1 
 
 		 682 aa  586  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.6 
 
 		 700 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  44 
 
 		 765 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.5 
 
 		 682 aa  578  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.5 
 
 		 682 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.5 
 
 		 682 aa  579  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.9 
 
 		 818 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.5 
 
 		 682 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.5 
 
 		 682 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  44.11 
 
 		 818 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.5 
 
 		 682 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.19 
 
 		 682 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.98 
 
 		 740 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.34 
 
 		 682 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.19 
 
 		 685 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.08 
 
 		 772 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.53 
 
 		 682 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.88 
 
 		 829 aa  568  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.65 
 
 		 805 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.1 
 
 		 778 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.93 
 
 		 772 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.1 
 
 		 832 aa  564  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 		 767 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.99 
 
 		 657 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 		 819 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.6 
 
 		 763 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 		 819 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.23 
 
 		 717 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.9 
 
 		 714 aa  555  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.18 
 
 		 773 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.29 
 
 		 779 aa  553  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.13 
 
 		 688 aa  554  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 818 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.19 
 
 		 842 aa  549  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.35 
 
 		 703 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.73 
 
 		 817 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.98 
 
 		 690 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.14 
 
 		 862 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 		 781 aa  541  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.02 
 
 		 776 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.53 
 
 		 815 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 827 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 		 812 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.64 
 
 		 842 aa  535  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 		 706 aa  534  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 827 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  43.19 
 
 		 700 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 		 686 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 		 704 aa  528  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.34 
 
 		 696 aa  525  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 		 681 aa  522  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 		 689 aa  519  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.22 
 
 		 712 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 846 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.17 
 
 		 695 aa  522  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 701 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.26 
 
 		 903 aa  519  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.93 
 
 		 772 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 		 822 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 846 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.78 
 
 		 904 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.25 
 
 		 822 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 		 706 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.07 
 
 		 787 aa  512  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.85 
 
 		 678 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.2 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 671 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.28 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.37 
 
 		 706 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 		 702 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.14 
 
 		 693 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 692 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.56 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.44 
 
 		 683 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 692 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 		 850 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.86 
 
 		 692 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.04 
 
 		 719 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 904 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.58 
 
 		 684 aa  505  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.5 
 
 		 686 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.99 
 
 		 706 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.17 
 
 		 697 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.5 
 
 		 686 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.93 
 
 		 676 aa  500  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>