More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1277 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  52.2 
 
 		 187 aa  191  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  44.57 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  45.11 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  46.96 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  44.86 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  43.48 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  46.45 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  43.09 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  41.08 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  43.33 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  43.85 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  40.33 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  40.22 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  40.44 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  38.67 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  38.67 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  38.67 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  38.67 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  38.67 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  39.25 
 
 		 189 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  45.76 
 
 		 178 aa  144  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  37.57 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.21 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  42.54 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  38.67 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  38.12 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  40.88 
 
 		 184 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 188 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  39.46 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  42.31 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  40 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  38.89 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  43.09 
 
 		 184 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  39.01 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  39.01 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  36.07 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  37.22 
 
 		 179 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  43.6 
 
 		 180 aa  131  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  43.6 
 
 		 180 aa  131  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  35.52 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  34.97 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  38.25 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  38.59 
 
 		 177 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  35.75 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2142  methyltransferase  39.66 
 
 		 195 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  45.33 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  37.57 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  34.24 
 
 		 191 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4018  hypothetical protein  39.53 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  37.02 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  37.02 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  37.02 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  39.47 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  38.95 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  36.98 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  36.02 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  35.33 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0307  methyltransferase  37.77 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499795  hitchhiker  0.00000453618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  36.02 
 
 		 187 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1500  methyltransferase  37.43 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  39.06 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  36.94 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  37.17 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1433  putative methyltransferase  34.38 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  35.91 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  34.39 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1527  methyltransferase  36.26 
 
 		 179 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3082  methyltransferase  38.73 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  34.32 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  41.3 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 191 aa  111  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  33.15 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  33.7 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  32.99 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  33.88 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  32.07 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  36.02 
 
 		 185 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  35.33 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2142  putative methyltransferase  36.42 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  34.21 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  34.21 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  34.38 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  32.76 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  35.62 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  32.43 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  33.33 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.22 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  34.05 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  30.27 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  30.27 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>