More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1260 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 138 aa  290  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  57.25 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  53.54 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  44.36 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.35 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.21 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  39.23 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.23 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.23 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.46 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.23 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.23 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.23 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.69 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.46 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  39.71 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  37.9 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.67 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  43.52 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  48.31 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  42.72 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  37.61 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  37.69 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.06 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.86 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.56 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  31.25 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.01 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  33.64 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.78 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  30.36 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  26.85 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0841  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.08 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2118  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.13 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.31 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.13 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.7 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  30.56 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  38.37 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  28.97 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  24.65 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  28.69 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  29.91 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.63 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>