More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1249 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
488 aa  1003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  63.38 
 
 
487 aa  648  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  62.75 
 
 
474 aa  602  1e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
469 aa  563  1e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  57.7 
 
 
478 aa  561  1e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  57.75 
 
 
474 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  57.55 
 
 
472 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  59.52 
 
 
465 aa  547  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  55.36 
 
 
475 aa  542  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.29805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  57.33 
 
 
478 aa  537  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  55.87 
 
 
465 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
477 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  54.86 
 
 
494 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  56.59 
 
 
475 aa  531  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  54.86 
 
 
494 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  53.03 
 
 
477 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  54.61 
 
 
467 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  55.1 
 
 
473 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  54.47 
 
 
466 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  54.64 
 
 
492 aa  523  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
475 aa  521  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  52.67 
 
 
468 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
473 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  55.43 
 
 
493 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  53.06 
 
 
474 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  54.21 
 
 
496 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
500 aa  516  1e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
499 aa  512  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
503 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  54.01 
 
 
470 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  53.32 
 
 
485 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  53.32 
 
 
485 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  52.06 
 
 
461 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  53.32 
 
 
485 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 
471 aa  506  1e-142  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
471 aa  507  1e-142  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
470 aa  507  1e-142  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
471 aa  506  1e-142  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 
471 aa  506  1e-142  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
471 aa  506  1e-142  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 
471 aa  506  1e-142  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 
471 aa  506  1e-142  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 
471 aa  506  1e-142  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  54.32 
 
 
471 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
475 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
471 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  53.46 
 
 
482 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  51.69 
 
 
481 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  53.36 
 
 
474 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  52.31 
 
 
468 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  52.39 
 
 
472 aa  498  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  54.64 
 
 
470 aa  500  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
473 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  54.1 
 
 
471 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  51.07 
 
 
478 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  50.86 
 
 
493 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  52.97 
 
 
466 aa  497  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
472 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  52.11 
 
 
462 aa  493  1e-138  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
488 aa  491  1e-138  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  51.78 
 
 
462 aa  494  1e-138  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
502 aa  493  1e-138  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
515 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
472 aa  490  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
466 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  52.95 
 
 
497 aa  490  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  51.72 
 
 
472 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  52.39 
 
 
482 aa  488  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  52.54 
 
 
480 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
484 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  52.77 
 
 
463 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
518 aa  487  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  48.53 
 
 
513 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
484 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
515 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
512 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
506 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  52.42 
 
 
495 aa  483  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  52.18 
 
 
503 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
515 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
525 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
487 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  51.54 
 
 
482 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
480 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
512 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  49.14 
 
 
534 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1052  amidophosphoribosyltransferase  50.1 
 
 
491 aa  478  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  48.83 
 
 
517 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  53.58 
 
 
466 aa  480  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
527 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
478 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  52.18 
 
 
479 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
496 aa  477  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
500 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
510 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
526 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
496 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
526 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
511 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
459 aa  474  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>