More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1238 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  66.97 
 
 		 114 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  54.21 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  51.4 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  52.83 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  47.66 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  48.6 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  42.48 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  47.96 
 
 		 110 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  54.02 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  47.12 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  43.81 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  45.79 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  42.27 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  41.75 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  45.19 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  40 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  42.31 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  40.19 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  44.23 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  45.19 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  43.27 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  44.04 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  44.23 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  44.23 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  41.82 
 
 		 117 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  44.23 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  40.57 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  44.23 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  40.57 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  46.15 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  40.57 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  45.1 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  39.62 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  40.57 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  46.07 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  41.12 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  45.05 
 
 		 198 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  45.05 
 
 		 198 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  40.57 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  38.05 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  43.96 
 
 		 191 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  39.62 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  39.62 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  46.15 
 
 		 141 aa  97.1  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  41.35 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  47.19 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  43.27 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  45.65 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  43.3 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  39.62 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  39.62 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  43.75 
 
 		 226 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  39.62 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  42.31 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  39.42 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  44.04 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  39.81 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  42.45 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  39.29 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  39.09 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0536  iojap-like protein  47.66 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.635311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  40.57 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  43.88 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  44.44 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  41.75 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4411  iojap-related protein  43.68 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0836383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4066  iojap-related protein  43.68 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.08408e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4076  iojap-related protein  43.68 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000293892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  43.68 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  37.96 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  43.68 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000071595  hitchhiker  0.00000138621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4450  iojap-related protein  43.68 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4463  iojap-related protein  43.68 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  40.74 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  40.95 
 
 		 144 aa  93.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  38.89 
 
 		 210 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  41.67 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  39.45 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  40.57 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000680321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  41.9 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  42 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  39.62 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  41.35 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  41.51 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08981  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  38.89 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  41.84 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  43 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  48.78 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  42.06 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  43.52 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  41.51 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  43 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  43 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  46.74 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  43 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  37.96 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>