More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1235 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 
6885 aa  13960  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  40.67 
 
 
631 aa  309  1e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  33.97 
 
 
2286 aa  235  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  34.67 
 
 
547 aa  215  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  32.82 
 
 
680 aa  211  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.7 
 
 
1462 aa  207  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  42.91 
 
 
2170 aa  204  4e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.12 
 
 
2073 aa  184  6e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  33.87 
 
 
3320 aa  181  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  28.17 
 
 
1887 aa  177  6e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  33.89 
 
 
609 aa  173  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  31.97 
 
 
1457 aa  170  7e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  31.29 
 
 
2375 aa  164  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  49.72 
 
 
729 aa  163  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.0624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  35.46 
 
 
803 aa  160  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  48.62 
 
 
743 aa  159  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  44.92 
 
 
459 aa  150  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.39148e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 
1495 aa  144  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  29.13 
 
 
2207 aa  143  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.64 
 
 
455 aa  142  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  42.39 
 
 
1042 aa  142  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.64 
 
 
455 aa  142  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  37.5 
 
 
455 aa  142  3e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  37.5 
 
 
455 aa  142  3e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  38.58 
 
 
667 aa  140  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.57497e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  37.92 
 
 
455 aa  140  1e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  37.5 
 
 
455 aa  140  1e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  40.7 
 
 
455 aa  139  2e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.52 
 
 
1016 aa  138  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  37.5 
 
 
455 aa  139  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  41 
 
 
455 aa  137  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  36.67 
 
 
455 aa  137  1e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  42.86 
 
 
973 aa  134  5e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  31.76 
 
 
1504 aa  132  2e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  41.94 
 
 
455 aa  130  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.8 
 
 
1260 aa  130  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  39.7 
 
 
458 aa  129  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  35.42 
 
 
456 aa  128  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  41.13 
 
 
2344 aa  128  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  31.9 
 
 
1174 aa  128  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  39.52 
 
 
930 aa  127  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  27.94 
 
 
1096 aa  126  2e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.51 
 
 
1661 aa  126  2e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  38.71 
 
 
458 aa  123  2e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.11699e-09 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  36.02 
 
 
932 aa  121  4e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  26.4 
 
 
1729 aa  120  7e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  6.07429e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  36.02 
 
 
779 aa  119  1e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  34.17 
 
 
456 aa  119  2e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.82 
 
 
809 aa  119  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.33 
 
 
1448 aa  118  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  23.87 
 
 
1847 aa  118  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  39.36 
 
 
598 aa  117  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  1.06126e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  30.98 
 
 
1628 aa  117  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  39.06 
 
 
935 aa  116  1e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.59 
 
 
729 aa  116  2e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  26.49 
 
 
675 aa  113  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.5 
 
 
1029 aa  110  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  37.8 
 
 
1050 aa  110  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  34 
 
 
548 aa  110  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  32.51 
 
 
733 aa  108  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.21 
 
 
465 aa  106  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  34.89 
 
 
1168 aa  106  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  37.3 
 
 
506 aa  105  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  37.84 
 
 
464 aa  105  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  34.81 
 
 
1009 aa  105  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  25.52 
 
 
1695 aa  104  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.16 
 
 
762 aa  104  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  35.33 
 
 
1226 aa  104  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  25.75 
 
 
1219 aa  103  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  37.43 
 
 
1321 aa  102  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  33.51 
 
 
756 aa  103  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  24.97 
 
 
5743 aa  101  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  40.35 
 
 
561 aa  101  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  38.25 
 
 
445 aa  101  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  35.71 
 
 
524 aa  101  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  31.74 
 
 
1221 aa  101  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  34.57 
 
 
573 aa  101  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  38.12 
 
 
1013 aa  100  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  32.49 
 
 
554 aa  100  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  23.42 
 
 
1452 aa  100  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  29.7 
 
 
618 aa  100  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.72 
 
 
995 aa  98.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  36.17 
 
 
854 aa  97.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  34.25 
 
 
920 aa  97.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.02 
 
 
1054 aa  95.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  26.91 
 
 
693 aa  96.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  32.36 
 
 
2334 aa  94.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  35.93 
 
 
531 aa  94.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.87 
 
 
480 aa  94.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3246  hypothetical protein  27.1 
 
 
2760 aa  94.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  32.37 
 
 
926 aa  94  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  27.58 
 
 
1141 aa  92.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  37.5 
 
 
997 aa  92  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  30.34 
 
 
2178 aa  91.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  38.71 
 
 
1160 aa  92  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  25.7 
 
 
741 aa  91.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  32.62 
 
 
506 aa  90.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  34.62 
 
 
542 aa  90.9  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  34.64 
 
 
921 aa  90.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.37339e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  53.85 
 
 
608 aa  90.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>