More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1199 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  100 
 
 
431 aa  882    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  58.39 
 
 
436 aa  535  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  50.81 
 
 
431 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  47.55 
 
 
434 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  45.27 
 
 
439 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  46.31 
 
 
431 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  44.34 
 
 
430 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  47.43 
 
 
434 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  45.5 
 
 
428 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  46.84 
 
 
426 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  43.46 
 
 
433 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  45.79 
 
 
428 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  43.72 
 
 
435 aa  363  2e-99  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  45.24 
 
 
432 aa  356  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  42.07 
 
 
431 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  40.65 
 
 
447 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  43.56 
 
 
434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  40.09 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  42.69 
 
 
420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  38.43 
 
 
445 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  42.65 
 
 
422 aa  308  8e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  41.71 
 
 
422 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  43.26 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  38.55 
 
 
435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  38.55 
 
 
435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  39.08 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  42.42 
 
 
422 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  38.62 
 
 
435 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  38.62 
 
 
435 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  38.62 
 
 
435 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  38.76 
 
 
435 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  38.39 
 
 
435 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  38.6 
 
 
441 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  44.15 
 
 
422 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  38.16 
 
 
435 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  43.3 
 
 
449 aa  295  8e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  38.23 
 
 
435 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  36.7 
 
 
440 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  36.28 
 
 
660 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  38.32 
 
 
433 aa  293  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1645  amidohydrolase  42.15 
 
 
438 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  42.16 
 
 
428 aa  290  3e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  35.31 
 
 
656 aa  289  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  41.4 
 
 
444 aa  286  7e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  35.99 
 
 
663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  36.78 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  39.09 
 
 
442 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  35.88 
 
 
442 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  38.28 
 
 
445 aa  282  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  40.23 
 
 
426 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  40 
 
 
432 aa  280  5e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  37.5 
 
 
440 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  41.07 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  40.73 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  38.51 
 
 
441 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1844  amidohydrolase  40.9 
 
 
405 aa  272  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  37.7 
 
 
445 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1806  amidohydrolase  41.99 
 
 
406 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  41.85 
 
 
381 aa  270  4e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  38.69 
 
 
435 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  39.04 
 
 
416 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  37.04 
 
 
422 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  36.41 
 
 
458 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  35.54 
 
 
663 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  36.45 
 
 
432 aa  266  7e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  39.79 
 
 
434 aa  266  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  39.58 
 
 
435 aa  265  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  37.47 
 
 
432 aa  263  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0532  amidohydrolase  40.65 
 
 
427 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.95 
 
 
442 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.71 
 
 
484 aa  259  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  38.02 
 
 
431 aa  259  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.71 
 
 
451 aa  259  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  36.43 
 
 
421 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  33.8 
 
 
440 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1034  amidohydrolase  35.65 
 
 
424 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0758  amidohydrolase  36.9 
 
 
442 aa  256  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1376  amidohydrolase  40.11 
 
 
427 aa  256  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000571224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1260  amidohydrolase  39.84 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  33.49 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.41 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.08 
 
 
445 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  39.17 
 
 
398 aa  251  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4080  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.71 
 
 
444 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.55583  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  33.41 
 
 
444 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1366  amidohydrolase  38.21 
 
 
459 aa  249  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.376571  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  35.75 
 
 
441 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  35.75 
 
 
441 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  35.1 
 
 
443 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  39.3 
 
 
413 aa  249  9e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.87 
 
 
455 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  33.65 
 
 
443 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.11 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.67 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.74 
 
 
448 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.53 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  35.04 
 
 
464 aa  243  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  35.44 
 
 
440 aa  242  7.999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  34.53 
 
 
444 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  32.93 
 
 
461 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>