146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1168 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1168  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  937    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.773328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  49.15 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  48.39 
 
 		 466 aa  441  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  42.25 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  43.68 
 
 		 467 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  43.56 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  43.6 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  42.73 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  39.84 
 
 		 481 aa  340  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  41.52 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0218  hypothetical protein  38.86 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0627935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  39.62 
 
 		 470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  39.18 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0918  AMMECR1 domain protein  32.33 
 
 		 436 aa  225  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1326  hypothetical protein  30.95 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01535  AMMECR1 domain protein  55.21 
 
 		 174 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02490  AMMECR1 domain protein  55.21 
 
 		 174 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000039521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  34.91 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02480  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.17 
 
 		 275 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01530  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  39.17 
 
 		 275 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1016  AMMECR1 domain protein  56.29 
 
 		 174 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  34.97 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  34.02 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  51.5 
 
 		 173 aa  161  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1241  AMMECR1 domain-containing protein  50.89 
 
 		 174 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1214  AMMECR1 domain-containing protein  50.89 
 
 		 174 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.83727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1690  AMMECR1 domain-containing protein  48.8 
 
 		 172 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1003  AMMECR1 domain-containing protein  47.59 
 
 		 172 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0238  AMMECR1 domain protein  46.99 
 
 		 180 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0237  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  33.21 
 
 		 268 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2866  AMMECR1 domain-containing protein  37.95 
 
 		 189 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0308  AMMECR1 domain protein  34.81 
 
 		 197 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043141  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  40.88 
 
 		 208 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  39.29 
 
 		 211 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  34.34 
 
 		 202 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  37.14 
 
 		 181 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2688  AMMECR1  33.77 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000703212  normal  0.0554703 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  38.76 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1577  AMMECR1 domain-containing protein  34.03 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000224473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  34.59 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2216  AMMECR1 domain protein  30.61 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0071  hypothetical protein  32.95 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  33.74 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  32.56 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1299  AMMECR1 domain-containing protein  33.59 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107414  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1122  AMMECR1  38.93 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2767  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1107  hypothetical protein  32.26 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02500  hypothetical protein  28.97 
 
 		 141 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.360289  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0447  AMMECR1  34.04 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.191172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0840  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.62 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1653  AMMECR1 domain protein  34.11 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000224046  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1344  hypothetical protein  35.25 
 
 		 200 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  35.82 
 
 		 193 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  33.33 
 
 		 183 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  28.25 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  24.32 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1162  AMMECR1 domain-containing protein  30.18 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  24.93 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1182  AMMECR1 domain protein  40.19 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2774  AMMECR1 domain protein  34.29 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  36.23 
 
 		 220 aa  69.3  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  27.43 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0034  AMMECR1 domain protein  31.85 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1850  AMMECR1  32.92 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  40.17 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  32.86 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1122  AMMECR1  39.25 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  24.75 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  34.29 
 
 		 190 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1250  AMMECR1 domain protein  39.25 
 
 		 184 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591105  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1407  hypothetical protein  24.72 
 
 		 259 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  31.16 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2470  AMMECR1 domain protein  33.76 
 
 		 200 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2447  AMMECR1 domain protein  36.7 
 
 		 183 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.255289  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  32.61 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0462  AMMECR1 domain protein  29.37 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  36.75 
 
 		 213 aa  63.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0449  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  25.73 
 
 		 252 aa  62.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1288  AMMECR1 domain-containing protein  38.02 
 
 		 186 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00113527  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  36.67 
 
 		 221 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4169  AMMECR1 domain protein  31.61 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399006  normal  0.593562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2712  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  27.08 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  34.59 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  34.18 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4112  AMMECR1  29.27 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1872  AMMECR1 domain-containing protein  32.08 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  36.3 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0712  AMMECR1 domain-containing protein  30.66 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  34.58 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1970  AMMECR1  30.2 
 
 		 180 aa  57  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.300723 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0283  hypothetical protein  26.35 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  29.71 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2682  hypothetical protein  30.47 
 
 		 202 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2830  AMMECR1  30.89 
 
 		 187 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1449  AMMECR1 domain protein  31.68 
 
 		 203 aa  56.6  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1957  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  31.4 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116994  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34758  predicted protein  30.89 
 
 		 211 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1312  AMMECR1 domain-containing protein  29.66 
 
 		 191 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.134499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4104  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  23.45 
 
 		 281 aa  54.3  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.141544  normal  0.0128083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>