38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1084 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  100 
 
 		 345 aa  708    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  40.24 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  35.81 
 
 		 372 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  34.15 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  29.74 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  28.79 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  30 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  29.67 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  28.4 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  27.25 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  27.85 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  25.76 
 
 		 352 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  29.45 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  24.91 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  25.67 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  25.33 
 
 		 335 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  26.24 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  24.26 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  25.19 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  24.81 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1644  aminoglycoside phosphotransferase  23.21 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  20.69 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2898  spore coat protein YutH  21.63 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0693926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  27.16 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3043  spore coat protein YutH  21.01 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  27.16 
 
 		 376 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0146  spore coat protein cotS  20.51 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4661  spore coat protein  20 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3555  spore coat protein YutH  21.13 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5088  spore coat protein cotS  20 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4773  spore coat protein YutH  19.69 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5096  spore coat protein cotS  20 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5188  spore coat protein cotS  20 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4680  spore coat protein  20 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4823  spore coat protein cotS  20 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5094  spore coat protein cotS  20 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  22.97 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>