46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1083 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  100 
 
 		 349 aa  719    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  33.85 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  30.66 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  30.51 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  30.27 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  28.57 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  28.24 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  28.79 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  30.07 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  28.29 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  27.33 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  26.33 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  26.33 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  23.71 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  27.4 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  26.21 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  25.15 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  25 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  25.34 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1644  aminoglycoside phosphotransferase  25.5 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  23.05 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  21.81 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3043  spore coat protein YutH  22.07 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2898  spore coat protein YutH  26.54 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0693926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  22.97 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  20.35 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  18.98 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0542  hypothetical protein  21.68 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3555  spore coat protein YutH  22.61 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4773  spore coat protein YutH  23.71 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4823  spore coat protein cotS  23.48 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4661  spore coat protein  23.48 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5188  spore coat protein cotS  23.48 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5094  spore coat protein cotS  23.48 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5096  spore coat protein cotS  23.48 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  29.3 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5058  spore coat protein cotS  22.62 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4680  spore coat protein  23.48 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5088  spore coat protein cotS  23.71 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0146  spore coat protein cotS  23.2 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  21.07 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1721  aminoglycoside phosphotransferase  21.32 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.496446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  23.11 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  24.21 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  21.26 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2527  aminoglycoside phosphotransferase  21.43 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>