More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1067 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  100 
 
 
297 aa  599  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  65.54 
 
 
298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  57.09 
 
 
302 aa  359  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  57.97 
 
 
302 aa  358  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  58.45 
 
 
302 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  56.42 
 
 
302 aa  346  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  56.61 
 
 
305 aa  345  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  56.76 
 
 
301 aa  343  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  56.42 
 
 
301 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  57.09 
 
 
301 aa  341  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  57.09 
 
 
301 aa  341  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  57.09 
 
 
301 aa  341  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  57.09 
 
 
301 aa  341  9e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  57.09 
 
 
301 aa  341  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  56.76 
 
 
301 aa  340  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  56.76 
 
 
300 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  56.76 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  56.76 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  56.42 
 
 
301 aa  339  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  56.16 
 
 
299 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  56.16 
 
 
299 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 
299 aa  332  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  56.31 
 
 
298 aa  332  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  55.59 
 
 
300 aa  331  9e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  52.35 
 
 
298 aa  329  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  53.4 
 
 
300 aa  329  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  54.24 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  53.9 
 
 
296 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  54.08 
 
 
308 aa  325  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  53.9 
 
 
299 aa  315  7e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  53.24 
 
 
303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  53.56 
 
 
299 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  54.08 
 
 
297 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  54.76 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  51.36 
 
 
299 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  52.04 
 
 
293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  51.18 
 
 
303 aa  305  7e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  53.4 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  48.12 
 
 
297 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  53.22 
 
 
297 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  47.64 
 
 
301 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  48.31 
 
 
294 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 
303 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  48.65 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
293 aa  275  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.64 
 
 
296 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 
303 aa  271  9e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 
306 aa  271  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  47.22 
 
 
301 aa  265  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  45.24 
 
 
307 aa  262  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 
301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
300 aa  259  6e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 
300 aa  258  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
301 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 
298 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  43.52 
 
 
314 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 
296 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 
297 aa  255  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 
315 aa  255  6e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  41.84 
 
 
295 aa  255  6e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  47.02 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 
299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 
303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  46.69 
 
 
313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 
315 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 
324 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
310 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
295 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  46.13 
 
 
299 aa  249  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
293 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  41 
 
 
312 aa  248  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 
306 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  41.86 
 
 
310 aa  248  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 
322 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 
301 aa  248  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 
306 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  40.8 
 
 
303 aa  246  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
314 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 
468 aa  245  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
314 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  42.19 
 
 
310 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  43.19 
 
 
310 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 
300 aa  241  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  39.09 
 
 
306 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 
337 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 
314 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  40.74 
 
 
299 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 
299 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1919  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 
313 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 
299 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  40.4 
 
 
311 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  42.03 
 
 
298 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>