More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1060 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  100 
 
 		 327 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  55.62 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  49.08 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  47.26 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  44.04 
 
 		 325 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  41.46 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  38.56 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  40.86 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  38.54 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  37.7 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  35.14 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  37.31 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  34.56 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  31.08 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  34.52 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  33.23 
 
 		 528 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  29.25 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0509225 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  29.22 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  30.88 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  30.29 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  28.06 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  29.41 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  28.27 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  32.67 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  32.55 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  27.12 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  33.2 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.2 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.2 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  26.95 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.83 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.04 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0148  AIR synthase-like protein  23.88 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  24.34 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  24.75 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.17 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.18 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.45 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.74 
 
 		 342 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.74 
 
 		 342 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.74 
 
 		 342 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  28.37 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.95 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.03 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.88 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.4 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.54 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.25 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.53 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.07 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.21 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.54 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.6 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.67 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.84 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.81 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.42 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.1 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.6 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.33 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.74 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.95 
 
 		 349 aa  89.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.91 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.16 
 
 		 337 aa  89.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.3 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.49 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.36 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.22 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.3 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.19 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.11 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.1 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.1 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.1 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.39 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.79 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.18 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.13 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.48 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.48 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.88 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.59 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.63 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 		 338 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.74 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.27 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.01 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.84 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.62 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.73 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.12 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.56 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.68 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.77 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.62 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.3 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.24 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  27.23 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.82 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>