More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0979 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  56.24 
 
 		 734 aa  860    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 723 aa  1475    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  43.53 
 
 		 711 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  45.64 
 
 		 649 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  40.55 
 
 		 719 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  40.36 
 
 		 695 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  39.97 
 
 		 713 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 		 705 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  39.84 
 
 		 740 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  40.44 
 
 		 708 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  37.95 
 
 		 708 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  39.08 
 
 		 682 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  36.75 
 
 		 721 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  36.48 
 
 		 728 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  36.46 
 
 		 727 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  36.68 
 
 		 727 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 		 649 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 		 704 aa  426  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  38.86 
 
 		 644 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  35.41 
 
 		 739 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  37.69 
 
 		 646 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  35.05 
 
 		 739 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  38.93 
 
 		 638 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  38.48 
 
 		 638 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  38.63 
 
 		 638 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  38.48 
 
 		 638 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  38.63 
 
 		 638 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  38.4 
 
 		 638 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  38.26 
 
 		 638 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  38.36 
 
 		 638 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  38.4 
 
 		 638 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  38.26 
 
 		 638 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  38.04 
 
 		 638 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.19 
 
 		 657 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  35.72 
 
 		 645 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 672 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  35.29 
 
 		 657 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 		 582 aa  343  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 662 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 		 657 aa  336  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 689 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.6 
 
 		 656 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 654 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.81 
 
 		 660 aa  319  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 		 651 aa  319  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 		 737 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 		 657 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  34.46 
 
 		 631 aa  303  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 		 727 aa  296  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 		 671 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.61 
 
 		 675 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 		 702 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 		 603 aa  287  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 		 684 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1853  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.88 
 
 		 624 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 		 675 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 		 675 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 		 612 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1199  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 		 612 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 680 aa  283  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.6 
 
 		 609 aa  281  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 		 675 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 673 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 		 570 aa  277  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 		 638 aa  276  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 736 aa  275  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  32.27 
 
 		 583 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 613 aa  273  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 		 613 aa  272  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 		 583 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1207  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.76 
 
 		 716 aa  271  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.222588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 692 aa  271  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 670 aa  271  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 		 673 aa  271  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 		 586 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.05 
 
 		 622 aa  269  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.15 
 
 		 710 aa  269  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  29.64 
 
 		 712 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 690 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.37 
 
 		 553 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 712 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.92 
 
 		 712 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  29.74 
 
 		 712 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  32.82 
 
 		 653 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  30.05 
 
 		 601 aa  264  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  31.91 
 
 		 578 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 712 aa  263  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 712 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 712 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2628  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 		 655 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.96 
 
 		 703 aa  263  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  29.88 
 
 		 597 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>