More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0933 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  100 
 
 
74 aa  141  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  81.08 
 
 
75 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  84.72 
 
 
75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  68.49 
 
 
80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  70.27 
 
 
74 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  72.97 
 
 
79 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  68.92 
 
 
76 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  68.06 
 
 
76 aa  103  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  67.61 
 
 
78 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  71.62 
 
 
78 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  66.2 
 
 
78 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  65.75 
 
 
76 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  100  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  68.92 
 
 
75 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  65.28 
 
 
81 aa  99.4  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  63.89 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  69.12 
 
 
79 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  63.89 
 
 
84 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  68.06 
 
 
77 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  66.67 
 
 
110 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  66.18 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  66.18 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  98.6  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  67.61 
 
 
78 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  62.5 
 
 
78 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  68.57 
 
 
78 aa  97.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  61.11 
 
 
78 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  66.2 
 
 
77 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  63.38 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  63.38 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  64.79 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  66.2 
 
 
77 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  66.2 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  65.28 
 
 
76 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  65.28 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  65.28 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  62.16 
 
 
79 aa  96.7  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  65.28 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  62.5 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  61.11 
 
 
78 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  64.79 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  66.18 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  67.14 
 
 
79 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  66.18 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  63.89 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  67.61 
 
 
80 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>