More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0847 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  84.86 
 
 		 186 aa  328  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  74.59 
 
 		 185 aa  288  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  70.81 
 
 		 185 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  70.27 
 
 		 185 aa  280  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  63.24 
 
 		 185 aa  254  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  63.24 
 
 		 185 aa  254  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  63.59 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  61.62 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  62.16 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  58.38 
 
 		 188 aa  239  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  56.22 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  55.98 
 
 		 185 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  55.98 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  58.38 
 
 		 185 aa  230  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  55.14 
 
 		 186 aa  227  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  57.61 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  57.07 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  53.8 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  53.8 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  214  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  53.55 
 
 		 204 aa  214  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  52.72 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  57.07 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  53.51 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  53.8 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  53.8 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  53.23 
 
 		 187 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  53.8 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  54.89 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  52.43 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  54.89 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  51.35 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  51.61 
 
 		 216 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  51.89 
 
 		 187 aa  204  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  51.63 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  51.35 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  51.63 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  51.63 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  51.09 
 
 		 189 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  51.63 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  51.35 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  50.81 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  51.63 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  49.73 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  51.63 
 
 		 185 aa  198  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  50.28 
 
 		 190 aa  197  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  50.54 
 
 		 187 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  50.27 
 
 		 187 aa  197  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  49.46 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  49.19 
 
 		 211 aa  197  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  49.73 
 
 		 187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  49.46 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  50.54 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  49.46 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  48.91 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  49.19 
 
 		 187 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  48.37 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  46.74 
 
 		 190 aa  195  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  48.91 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  49.72 
 
 		 190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  49.72 
 
 		 190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  48.91 
 
 		 186 aa  194  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  48.9 
 
 		 188 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  50.54 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  53.48 
 
 		 190 aa  194  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  50.82 
 
 		 199 aa  194  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  48.11 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  49.16 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  48.91 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  46.49 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  48.37 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  48.11 
 
 		 189 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  47.83 
 
 		 185 aa  191  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  48.11 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  48.37 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  47.25 
 
 		 189 aa  191  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  47.8 
 
 		 187 aa  190  8e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>