More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0831 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  55.18 
 
 		 294 aa  331  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  54.42 
 
 		 294 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  52.19 
 
 		 295 aa  298  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  52.33 
 
 		 295 aa  295  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  51.25 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  52.04 
 
 		 316 aa  277  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  48.99 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  50.56 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  49.5 
 
 		 296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  51.01 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  49.82 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  50 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  51.51 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  47.83 
 
 		 312 aa  265  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  52.4 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  49.5 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  46.94 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  45.27 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 306 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  48.81 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  50.57 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  47.6 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  47.75 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.08 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  44.33 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  46.94 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  55.08 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.19 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  48.5 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  47.6 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  50.85 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  47.5 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 286 aa  245  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  43.43 
 
 		 337 aa  245  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  43.16 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  51.5 
 
 		 295 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  49.24 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  40.8 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  49.24 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  44.95 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  44.88 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  50.75 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  51.37 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  42.38 
 
 		 308 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  50.76 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  50.57 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  49.81 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  49.81 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  43.52 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  49.62 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  51.69 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  48.59 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  43.52 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  41.72 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  42.71 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  47.54 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  48.86 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  48.86 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  48.86 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  48.86 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  48.86 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.69 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  47.46 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  45.24 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  48.11 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  48.11 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  44.93 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  42.38 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.3 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  45.04 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  45.72 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  42.24 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  43.88 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  48.19 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  44.26 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  47.2 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  45.64 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  42.56 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  42.52 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  42.52 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  45.85 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  45.04 
 
 		 293 aa  224  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>