169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0825 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
649 aa  1351    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  63.34 
 
 
646 aa  848    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  35.54 
 
 
591 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  33.64 
 
 
578 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.09 
 
 
582 aa  294  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  36.91 
 
 
854 aa  283  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  32.92 
 
 
587 aa  283  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  32.49 
 
 
571 aa  281  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 
895 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  30.43 
 
 
885 aa  253  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  29.98 
 
 
537 aa  233  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  29.22 
 
 
874 aa  232  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 
1224 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  29.27 
 
 
1100 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.37 
 
 
867 aa  210  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  30.09 
 
 
775 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  28.64 
 
 
833 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 
812 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.24 
 
 
998 aa  203  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.77 
 
 
762 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.1 
 
 
927 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  28.83 
 
 
1105 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  27.95 
 
 
864 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  30.1 
 
 
851 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.13 
 
 
900 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  29.77 
 
 
875 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.5 
 
 
611 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 
1601 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.63 
 
 
786 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 
611 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 
563 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 
606 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  25.93 
 
 
526 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 
632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  24.77 
 
 
665 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.59 
 
 
803 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  24.63 
 
 
739 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  23.87 
 
 
621 aa  90.9  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  25 
 
 
949 aa  90.9  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  51.81 
 
 
415 aa  90.5  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  50.65 
 
 
484 aa  87.4  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  62.32 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  46.49 
 
 
1077 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 
707 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
742 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  21.65 
 
 
1076 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
730 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  23.98 
 
 
815 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  47.95 
 
 
736 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  26.14 
 
 
686 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 
814 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  56.76 
 
 
922 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  54.29 
 
 
591 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.39 
 
 
906 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  56.72 
 
 
630 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  53.03 
 
 
773 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.47 
 
 
582 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  58.21 
 
 
741 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  42.31 
 
 
600 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  58.46 
 
 
533 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 
961 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
928 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  53.42 
 
 
566 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  50 
 
 
571 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  50.72 
 
 
948 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.75 
 
 
842 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  53.62 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  43.42 
 
 
590 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  43.82 
 
 
820 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  50.79 
 
 
619 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  52.24 
 
 
660 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  53.73 
 
 
789 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  27.19 
 
 
725 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  50 
 
 
900 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.53 
 
 
469 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 
739 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  50.72 
 
 
554 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  35.96 
 
 
965 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  22.97 
 
 
757 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  43.68 
 
 
567 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  24.71 
 
 
794 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  22.63 
 
 
978 aa  71.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
710 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  49.28 
 
 
639 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.44 
 
 
831 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  23.97 
 
 
715 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  50.7 
 
 
580 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 
563 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  54.69 
 
 
533 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  52.17 
 
 
537 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  38.33 
 
 
928 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  51.52 
 
 
679 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.88 
 
 
985 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  52.94 
 
 
707 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  47.06 
 
 
982 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  39.19 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.63 
 
 
528 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  27 
 
 
880 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.03 
 
 
790 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  49.18 
 
 
501 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>