191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0797 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
814 aa  1682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  48.89 
 
 
436 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  36.08 
 
 
475 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  41.74 
 
 
469 aa  267  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  40.34 
 
 
545 aa  218  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
621 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  31.54 
 
 
681 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  32.51 
 
 
502 aa  197  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  36.87 
 
 
516 aa  195  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  35.88 
 
 
402 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  32.54 
 
 
578 aa  190  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.47 
 
 
360 aa  188  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  33.63 
 
 
593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  33.02 
 
 
743 aa  174  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  33.05 
 
 
900 aa  170  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.6 
 
 
366 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  31.51 
 
 
584 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  31.3 
 
 
451 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  30.34 
 
 
572 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  30.99 
 
 
589 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  32.88 
 
 
335 aa  153  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  33.44 
 
 
572 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4327  GDSL family lipase  31.23 
 
 
366 aa  147  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  32.42 
 
 
335 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0721  hypothetical protein  34.63 
 
 
387 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.706774  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 
343 aa  134  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1254  GDSL family lipase  36.8 
 
 
357 aa  134  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000525756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  31.15 
 
 
566 aa  130  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  30.64 
 
 
332 aa  129  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  34.89 
 
 
495 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  29.29 
 
 
312 aa  126  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  24.6 
 
 
660 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  30.63 
 
 
545 aa  114  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2933  acetylxylan esterase  33.49 
 
 
208 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00634363  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4965  GDSL family lipase  28.29 
 
 
366 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.517608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  43.05 
 
 
707 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  50.5 
 
 
736 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.9 
 
 
366 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0113749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 
526 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  57.83 
 
 
582 aa  99.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4674  lipolytic protein G-D-S-L family  30.38 
 
 
334 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  29.41 
 
 
503 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.26 
 
 
831 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  50.98 
 
 
739 aa  91.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  53.75 
 
 
591 aa  90.9  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1295  lipase/acylhydrolase, putative  26.79 
 
 
390 aa  90.1  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.336383  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.25 
 
 
469 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  31.28 
 
 
415 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  34.27 
 
 
484 aa  89  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  49.47 
 
 
710 aa  87.8  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  52 
 
 
619 aa  87.8  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.25 
 
 
842 aa  87.4  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3143  hypothetical protein  22.41 
 
 
369 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  51.16 
 
 
334 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4673  lipolytic protein G-D-S-L family  26.3 
 
 
331 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.25 
 
 
790 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 
332 aa  84  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  39.45 
 
 
922 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  42.73 
 
 
600 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 
649 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  43.64 
 
 
554 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 
563 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  57.14 
 
 
820 aa  82  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1140  GDSL family lipase  25 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  41.6 
 
 
1077 aa  81.3  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  53.85 
 
 
571 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  43.43 
 
 
639 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  55.88 
 
 
630 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  42.68 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.37 
 
 
1051 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  53.62 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  55.07 
 
 
611 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  53.52 
 
 
566 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  51.52 
 
 
789 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  26.65 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  50.77 
 
 
773 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.7 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  25.89 
 
 
673 aa  75.1  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  43.52 
 
 
707 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  54.17 
 
 
895 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  52.05 
 
 
710 aa  74.7  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  36.36 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  39.39 
 
 
621 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 
535 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  47.76 
 
 
532 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
590 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  52.11 
 
 
563 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.57 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 
741 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 
928 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  48.1 
 
 
599 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 
961 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  47.44 
 
 
580 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  50.75 
 
 
982 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  49.23 
 
 
533 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 
742 aa  68.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  51.47 
 
 
679 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  45.71 
 
 
425 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
683 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>