71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0790 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0790  hythetical protein  100 
 
 		 94 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000412009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  38.55 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1890  protein of unknown function YGGT  43.24 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000126042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  40.54 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  45.33 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  46.58 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  36 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  36 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  36 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  36 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  36 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  36 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  36.05 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  36 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  34.88 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  34.67 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  33.33 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  30.12 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  29.87 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0140  YggT family membrane protein  35 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  34.78 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0829  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0828  YggT family membrane protein  32.5 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  30 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  30.77 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2921  protein of unknown function YGGT  32.91 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.317852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  43.48 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  30.67 
 
 		 196 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  38.98 
 
 		 184 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  30.67 
 
 		 196 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  30.99 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  33.82 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  33.72 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  33.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  26.74 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  31.17 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  30.67 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  33.8 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  35.59 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  35.9 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  26.74 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  33.8 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  40  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  41.82 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>