More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0761 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  56.86 
 
 
255 aa  295  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  51.79 
 
 
257 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  51 
 
 
277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  54.19 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  50.2 
 
 
257 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  52.02 
 
 
255 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  49.4 
 
 
260 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  56.7 
 
 
230 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  54.4 
 
 
219 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  56.94 
 
 
257 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  56.94 
 
 
257 aa  218  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  56.94 
 
 
257 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  55.73 
 
 
206 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  56.48 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  56.48 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  52.49 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  55.9 
 
 
253 aa  215  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  56.48 
 
 
257 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  56.02 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  49.54 
 
 
253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  55.85 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  49.8 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  50.8 
 
 
259 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  56.61 
 
 
208 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  53.46 
 
 
308 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  56.19 
 
 
230 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  55.85 
 
 
216 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  53.24 
 
 
260 aa  201  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  48.68 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  50.5 
 
 
217 aa  199  3e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  53.12 
 
 
213 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  44.76 
 
 
250 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.03 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.79 
 
 
210 aa  195  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  55.85 
 
 
217 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  52.36 
 
 
211 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  51.83 
 
 
211 aa  191  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  41.6 
 
 
256 aa  189  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  52.81 
 
 
240 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  47.24 
 
 
283 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.47 
 
 
198 aa  188  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  50.27 
 
 
212 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  51.31 
 
 
212 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  39.37 
 
 
338 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  48.96 
 
 
227 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  46.23 
 
 
283 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  45.23 
 
 
283 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  53.37 
 
 
209 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  53.37 
 
 
209 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  52.53 
 
 
232 aa  184  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  50.26 
 
 
207 aa  184  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  49.73 
 
 
211 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  50.82 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.16 
 
 
198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  53.93 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  54.4 
 
 
233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  54.4 
 
 
233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  51.08 
 
 
224 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  52.51 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  49.43 
 
 
197 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50.56 
 
 
199 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  57.07 
 
 
199 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  44.22 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.7 
 
 
206 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  52.72 
 
 
197 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  50 
 
 
208 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  47.72 
 
 
210 aa  177  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  52.25 
 
 
218 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  51.12 
 
 
235 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.41 
 
 
202 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.41 
 
 
202 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  51.12 
 
 
240 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50.28 
 
 
201 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.94 
 
 
206 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  51.11 
 
 
208 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  51.58 
 
 
197 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  49.72 
 
 
201 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  49.21 
 
 
220 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50.54 
 
 
199 aa  175  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  48.88 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  49.15 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  51.52 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  49.21 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  48.4 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  48.6 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  46.35 
 
 
207 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  49.44 
 
 
209 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  49.19 
 
 
213 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  50.28 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  50 
 
 
203 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.41 
 
 
217 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  50.86 
 
 
203 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50.28 
 
 
213 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  48.02 
 
 
198 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  49.73 
 
 
211 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.41 
 
 
217 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  45.11 
 
 
214 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  48.11 
 
 
207 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  45.65 
 
 
214 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>