217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0756 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  100 
 
 
311 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  61.29 
 
 
312 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  51.28 
 
 
333 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  46.79 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  42.12 
 
 
315 aa  265  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  43.85 
 
 
315 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  43.67 
 
 
313 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  42.12 
 
 
307 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  39.81 
 
 
311 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  40.51 
 
 
328 aa  238  8e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  41.61 
 
 
307 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  40.39 
 
 
307 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  40 
 
 
307 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  39.68 
 
 
307 aa  228  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  39.74 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  40 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  40 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  39.68 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  40 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  40 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  40.32 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  39.12 
 
 
320 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  38.49 
 
 
320 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  35.17 
 
 
444 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  38.69 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  34.35 
 
 
429 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  39.02 
 
 
307 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  38.01 
 
 
438 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  34.26 
 
 
419 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  32.81 
 
 
420 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  34.63 
 
 
348 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  38.87 
 
 
337 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  35.74 
 
 
315 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  36.77 
 
 
297 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  31.53 
 
 
394 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  34.26 
 
 
399 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  34.89 
 
 
317 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  33.13 
 
 
433 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  31.83 
 
 
359 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 
345 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  33.54 
 
 
342 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  35.64 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  34.72 
 
 
354 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  29.49 
 
 
381 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  28.57 
 
 
342 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  29.71 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  31.91 
 
 
390 aa  178  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  31.56 
 
 
388 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  30.94 
 
 
402 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  34.21 
 
 
342 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  30.17 
 
 
412 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  32.28 
 
 
602 aa  172  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  30.3 
 
 
402 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  31.75 
 
 
344 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  31.01 
 
 
412 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  36.59 
 
 
355 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  30.42 
 
 
399 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  29.81 
 
 
444 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 
433 aa  165  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  34.95 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  30.17 
 
 
418 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  36.29 
 
 
350 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  30.42 
 
 
360 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  33.68 
 
 
352 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  28.61 
 
 
355 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  32.08 
 
 
352 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  29.67 
 
 
346 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  29.67 
 
 
346 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  29.17 
 
 
346 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  32.76 
 
 
415 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  32.42 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  33.33 
 
 
353 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  31.21 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  32.72 
 
 
332 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  31 
 
 
323 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  30.58 
 
 
349 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  30.58 
 
 
349 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  28.24 
 
 
349 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  26.8 
 
 
439 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  31.25 
 
 
355 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.01 
 
 
355 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  36.5 
 
 
332 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  29.46 
 
 
419 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  25.72 
 
 
355 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  32.8 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  30.97 
 
 
344 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  37.67 
 
 
397 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  27.86 
 
 
323 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  34.25 
 
 
306 aa  139  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  28.18 
 
 
323 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  29.39 
 
 
324 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  30.34 
 
 
350 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  27.96 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  27.7 
 
 
323 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  27.84 
 
 
323 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  27.84 
 
 
323 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  32 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  27.7 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  28.18 
 
 
323 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  27.49 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>