More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0743 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  100 
 
 		 484 aa  973    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  33.12 
 
 		 460 aa  236  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 453 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  25 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  24.79 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  26.19 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  25.47 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  25.6 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  27.86 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.03 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0687  DNA damage inducible protein - mate transporter family  26.28 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  25.49 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 464 aa  133  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 461 aa  124  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  22.4 
 
 		 480 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.45 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 448 aa  103  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  22 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  25.59 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.07 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.07 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  23.8 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.24 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 480 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  24.62 
 
 		 454 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.25 
 
 		 443 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 485 aa  100  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  21.84 
 
 		 469 aa  100  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  22.05 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  21.84 
 
 		 469 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  21.84 
 
 		 469 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  21.84 
 
 		 469 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  23.04 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 461 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  24.6 
 
 		 455 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 469 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 469 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 454 aa  97.1  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.95 
 
 		 462 aa  96.7  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  22.48 
 
 		 449 aa  96.7  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  24.3 
 
 		 452 aa  96.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 483 aa  96.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  21.83 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  25.53 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 438 aa  94  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 486 aa  94.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 455 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 455 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 451 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  22.17 
 
 		 476 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25.79 
 
 		 466 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 471 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0811  multidrug efflux protein  26.47 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>