More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0612 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0612  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 503 aa  996    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000214976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  50.4 
 
 		 508 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.3 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.11 
 
 		 489 aa  448  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.3 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  47.11 
 
 		 489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  46.91 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0068  Na+/solute symporter  49.4 
 
 		 512 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01330  Na+/proline symporter  49.2 
 
 		 525 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1759  Na+ symporter  42.45 
 
 		 531 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  32.06 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  30.04 
 
 		 487 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.54 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  29.84 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  29.84 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  29.84 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  29.84 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  29.84 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.79 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  29.64 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 483 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.45 
 
 		 533 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  29.23 
 
 		 492 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  29.23 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.66 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  29.64 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  27.29 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.91 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  31.12 
 
 		 491 aa  167  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  29.93 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  29.38 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  29.55 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  27.67 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  29.73 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  29.21 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  29.55 
 
 		 489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  29.03 
 
 		 492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  29.7 
 
 		 492 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  28.69 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  30.28 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  29.87 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  28.89 
 
 		 483 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  28.92 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.68 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  30.28 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  25.36 
 
 		 537 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  30.28 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  30.28 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  30.28 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  30.28 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  31.92 
 
 		 499 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  29.42 
 
 		 492 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  28.67 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  28.08 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  30.59 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  30.47 
 
 		 502 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  28.67 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  29.23 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  29.21 
 
 		 488 aa  158  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  29.46 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1190  sodium/proline symporter  29.57 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.969329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1220  sodium/proline symporter  29.57 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1200  sodium/proline symporter  29.57 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  29.44 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1235  sodium/proline symporter  29.57 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0211084  normal  0.60164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  30.02 
 
 		 506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  27.84 
 
 		 498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  28.44 
 
 		 483 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  28.44 
 
 		 483 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  26.35 
 
 		 528 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  28.44 
 
 		 483 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  28.44 
 
 		 483 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2302  sodium/proline symporter  29.89 
 
 		 502 aa  156  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  31.22 
 
 		 498 aa  156  9e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  30.11 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  30.11 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  30.18 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  29.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  28 
 
 		 497 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1253  sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.325594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1085  sodium/proline symporter  29.35 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  29.66 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  24.59 
 
 		 528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.36 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  26.93 
 
 		 553 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1653  sodium/proline symporter  29.23 
 
 		 511 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  25 
 
 		 527 aa  153  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  29.35 
 
 		 484 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  29.12 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  29.5 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  29.82 
 
 		 494 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.29 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  29.82 
 
 		 494 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  29.8 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  28.88 
 
 		 492 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1860  sodium/proline symporter  29.73 
 
 		 496 aa  150  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0914218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>