85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0584 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  191  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  48.86 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  43.96 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  40.45 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  41.76 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1743  protein of unknown function DUF503  38.3 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  40.22 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  39.78 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  37.63 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  39.56 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  46.15 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  37.66 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  37.66 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  39.74 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  40.22 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  40.66 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  34.78 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  39.53 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  39.53 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  37.23 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  32.97 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3852  protein of unknown function DUF503  34 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.411613  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3726  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.40241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0394209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  43.04 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  35.44 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  30.85 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  35.06 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0361  protein of unknown function DUF503  34.18 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  32.56 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  30.23 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  36.99 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  31.4 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0779  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0539  hypothetical protein  28.12 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0676  protein of unknown function DUF503  26.6 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3561  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386445  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  32.56 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  34.25 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  34.25 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  35.62 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  35.59 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  32.63 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.100296  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0708  hypothetical protein  34.78 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  30 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  24.42 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  51.02 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  30.67 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12149  hypothetical protein  27.91 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2131  protein of unknown function DUF503  29.79 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  30.14 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  33.85 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2117  hypothetical protein  32.18 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1915  hypothetical protein  26.44 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.650428  hitchhiker  0.0000323076 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  38.03 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  26.74 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3066  hypothetical protein  26.74 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  30.77 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  30.77 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  30.77 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  48.89 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1062  hypothetical protein  28.74 
 
 		 99 aa  42  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.0510032 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0058  protein of unknown function DUF503  28.72 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  30.77 
 
 		 102 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0229  hypothetical protein  28.72 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000241411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1142  hypothetical protein  28.21 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1180  hypothetical protein  28.21 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1412  hypothetical protein  27.06 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>