More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0580 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 397 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  58.73 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  55.98 
 
 		 393 aa  474  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  56.35 
 
 		 397 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  54.55 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  52.54 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  51.78 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  53.55 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  53.67 
 
 		 395 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  51.27 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  52.79 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  52.79 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  51.78 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  50.76 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  47.18 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  47.98 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  48.05 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  43.57 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  43.96 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  44.16 
 
 		 397 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  41.49 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  41.49 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  41.62 
 
 		 461 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  39.54 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  39.03 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  39.79 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  38.36 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  39.29 
 
 		 395 aa  299  6e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  37.06 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.4 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  36.57 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  33.59 
 
 		 403 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  29.9 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  31.74 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  34.31 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  34.31 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.73 
 
 		 404 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  32.36 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  34.84 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  33.33 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  34.31 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  34.49 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  34.49 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  34.49 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  34.49 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  34.49 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  32.36 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  33.51 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  31.84 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  31.48 
 
 		 387 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  30.32 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  31.31 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  32.89 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  30.77 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  32.56 
 
 		 395 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  33.5 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.76 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  33.77 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  30.97 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.89 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  30.85 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  31.14 
 
 		 396 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  30.32 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  30.42 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.88 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  30.08 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  32.82 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  32.17 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  30.34 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.93 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  29.82 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  32.42 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.93 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  29.82 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  29.82 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.41 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  29.95 
 
 		 402 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  30.41 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  31.54 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  32.44 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  31.27 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  30.41 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 		 404 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  32.14 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  29.19 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  32.96 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  31.17 
 
 		 390 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  29.86 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  31.62 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  28.32 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  31.62 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>