More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0572 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 
349 aa  716  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  65.78 
 
 
349 aa  492  1e-138  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.39 
 
 
342 aa  398  1e-110  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  51.16 
 
 
349 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.52 
 
 
347 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.81 
 
 
347 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  51.03 
 
 
356 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  53.21 
 
 
350 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.44 
 
 
364 aa  360  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.44 
 
 
364 aa  360  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.11 
 
 
365 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  50.74 
 
 
348 aa  357  2e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  52.11 
 
 
341 aa  356  3e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.26 
 
 
364 aa  356  4e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.11 
 
 
364 aa  355  7e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.85 
 
 
362 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.26 
 
 
362 aa  349  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
362 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
362 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
362 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
362 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
362 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
362 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
362 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.97 
 
 
362 aa  348  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.56 
 
 
362 aa  347  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  48.7 
 
 
349 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  47.26 
 
 
360 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  47.54 
 
 
351 aa  327  2e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.1 
 
 
343 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  47.23 
 
 
318 aa  322  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.13 
 
 
389 aa  321  1e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.25 
 
 
343 aa  320  2e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.99 
 
 
368 aa  317  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.09 
 
 
348 aa  316  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  44.67 
 
 
354 aa  308  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  8.83258e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  44.67 
 
 
341 aa  308  1e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.07 
 
 
340 aa  300  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.27 
 
 
347 aa  299  4e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.8 
 
 
365 aa  295  6e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  44.19 
 
 
348 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  44.81 
 
 
371 aa  292  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1999  hypothetical protein  43.1 
 
 
394 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  43.03 
 
 
344 aa  290  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  42.65 
 
 
382 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  41.79 
 
 
383 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  41.79 
 
 
374 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  41.31 
 
 
397 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  43.54 
 
 
353 aa  287  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  8.42526e-08 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  42.34 
 
 
356 aa  286  3e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  40.4 
 
 
357 aa  286  3e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  41.62 
 
 
373 aa  285  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  42.2 
 
 
382 aa  285  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  42.73 
 
 
382 aa  285  1e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  42.73 
 
 
365 aa  283  2e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.77 
 
 
346 aa  284  2e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.1721e-08  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.4 
 
 
363 aa  283  4e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  41.95 
 
 
376 aa  282  6e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  43.75 
 
 
342 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.76 
 
 
361 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 
342 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  42.35 
 
 
364 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  39.7 
 
 
367 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.1 
 
 
354 aa  279  6e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.98 
 
 
371 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  41.35 
 
 
377 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  41.35 
 
 
372 aa  277  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 
378 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.14 
 
 
355 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
347 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  41.18 
 
 
345 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0083  radical SAM protein  40.82 
 
 
391 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.44 
 
 
355 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2310  hypothetical protein  41.21 
 
 
382 aa  275  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  41.47 
 
 
344 aa  275  1e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.18 
 
 
343 aa  275  1e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.1547e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.45 
 
 
344 aa  274  2e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  41.69 
 
 
369 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  41.55 
 
 
351 aa  273  4e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.48 
 
 
351 aa  272  5e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  40.58 
 
 
372 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  42.86 
 
 
382 aa  271  9e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  40.22 
 
 
402 aa  271  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.98 
 
 
382 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  41.06 
 
 
370 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  41.06 
 
 
370 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  40.58 
 
 
372 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  39.45 
 
 
384 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  39.45 
 
 
384 aa  270  3e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  40 
 
 
393 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  40 
 
 
372 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  39.73 
 
 
383 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  40.29 
 
 
462 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.26812e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.86 
 
 
358 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 
351 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.97 
 
 
354 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  40.23 
 
 
378 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  40.23 
 
 
378 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 
361 aa  266  3e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  40.23 
 
 
378 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>