165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0536 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  73.43 
 
 		 539 aa  840    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 563 aa  1157    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  49.46 
 
 		 526 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  45.78 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  46.25 
 
 		 1414 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  41.87 
 
 		 534 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  47.82 
 
 		 619 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  45.63 
 
 		 633 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  45.77 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  44.92 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  44.02 
 
 		 658 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  46.5 
 
 		 580 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  43.04 
 
 		 649 aa  364  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  42.45 
 
 		 660 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 		 562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  31.56 
 
 		 542 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  30.24 
 
 		 608 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.19 
 
 		 2305 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.96 
 
 		 2310 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  28.34 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  28.84 
 
 		 480 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  26.54 
 
 		 614 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  62.86 
 
 		 477 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  45.54 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  43.52 
 
 		 707 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  42.22 
 
 		 922 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  39.87 
 
 		 730 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  58.21 
 
 		 1224 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 741 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  53.85 
 
 		 895 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 		 1601 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  46.39 
 
 		 591 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  51.28 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  41.28 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  58.21 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  47.5 
 
 		 600 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 736 aa  77  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  35.04 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  24.76 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  47.44 
 
 		 928 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.11 
 
 		 831 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  50.7 
 
 		 814 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.97 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  50.63 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  51.52 
 
 		 611 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  48 
 
 		 630 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.75 
 
 		 842 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.11 
 
 		 790 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  50 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  38.95 
 
 		 739 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  52 
 
 		 619 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  46.15 
 
 		 900 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  51.43 
 
 		 837 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  23.69 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 		 773 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  49.3 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  43.06 
 
 		 558 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  48.48 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  45.95 
 
 		 580 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.22 
 
 		 1051 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  49.25 
 
 		 961 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  49.32 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.53 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.96 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  48.44 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  40 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  54.1 
 
 		 528 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 		 1077 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  49.25 
 
 		 948 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  50 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  44.93 
 
 		 955 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 		 725 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  34.48 
 
 		 599 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  40.48 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  44.59 
 
 		 780 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  50 
 
 		 982 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  48.48 
 
 		 679 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  45.9 
 
 		 746 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  46.77 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  22.27 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  45.71 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.59 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.28 
 
 		 710 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  38.78 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.77 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  48.39 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  22.77 
 
 		 584 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  42.62 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  47.62 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  46.77 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  43.66 
 
 		 949 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.77 
 
 		 537 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  43.04 
 
 		 683 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>