123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0492 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
206 aa  397  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  67.65 
 
 
205 aa  272  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  55.61 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.73 
 
 
205 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.97 
 
 
205 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.24 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.48 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.02 
 
 
211 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.88 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  43.56 
 
 
204 aa  167  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.36 
 
 
205 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.29 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.08 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.09 
 
 
212 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.78 
 
 
205 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.39 
 
 
207 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.31 
 
 
217 aa  154  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.72 
 
 
198 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.49 
 
 
202 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.9 
 
 
204 aa  146  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.93 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.73 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.32 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.99 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.24 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.24 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.47 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.69 
 
 
203 aa  104  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  34.67 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.28 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.28 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.49 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.54 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  29.89 
 
 
1010 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.95 
 
 
546 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.22 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.64 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  30.71 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.29 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.62 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.62 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.88 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  33.57 
 
 
378 aa  65.5  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.82 
 
 
357 aa  65.1  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  25.95 
 
 
401 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.34 
 
 
369 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  28.43 
 
 
321 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.14 
 
 
417 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.64 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  34.09 
 
 
375 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  33.58 
 
 
381 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.85 
 
 
346 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.91 
 
 
375 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  28.68 
 
 
401 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.06 
 
 
406 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.82 
 
 
370 aa  58.9  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  28 
 
 
393 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  30 
 
 
572 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  27.65 
 
 
406 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.77 
 
 
398 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.67 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.89 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  28.37 
 
 
360 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  29.1 
 
 
411 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.11 
 
 
346 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  26.45 
 
 
372 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.12 
 
 
331 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.71 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.1 
 
 
418 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.99 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.63 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.63 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.78 
 
 
333 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  28.47 
 
 
422 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2720  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.17 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.39 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.87 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.83 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  30.43 
 
 
548 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.15 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.38 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.83 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 
546 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 
546 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 
546 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 
546 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.3 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0957  CheC, inhibitor of MCP methylation  19.29 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  26.87 
 
 
546 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 
546 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  27.46 
 
 
402 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.68 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  26.87 
 
 
546 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  26.62 
 
 
554 aa  48.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  26.92 
 
 
546 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.3 
 
 
422 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.94 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  27.13 
 
 
545 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.67 
 
 
399 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>