More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0485 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.09 
 
 
688 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.7 
 
 
696 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.29 
 
 
692 aa  673    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
676 aa  1338    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  50 
 
 
692 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.12 
 
 
694 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.15 
 
 
682 aa  680    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
694 aa  646    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.85 
 
 
681 aa  719    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.43 
 
 
694 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.75 
 
 
690 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.06 
 
 
689 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.56 
 
 
697 aa  648    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.48 
 
 
690 aa  663    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.22 
 
 
695 aa  669    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.83 
 
 
678 aa  769    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  58 
 
 
686 aa  787    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.81 
 
 
673 aa  746    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 
692 aa  646    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.45 
 
 
679 aa  755    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.19 
 
 
686 aa  721    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.84 
 
 
674 aa  935    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.87 
 
 
695 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.89 
 
 
677 aa  775    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.8 
 
 
688 aa  717    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.46 
 
 
692 aa  622  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.59 
 
 
703 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.34 
 
 
678 aa  608  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.34 
 
 
678 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.83 
 
 
695 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.84 
 
 
696 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.67 
 
 
717 aa  598  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.75 
 
 
708 aa  595  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.89 
 
 
696 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.36 
 
 
703 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2029  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.82 
 
 
684 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.97 
 
 
680 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.74 
 
 
708 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.57 
 
 
687 aa  575  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1438  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.49 
 
 
680 aa  569  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.937514  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.34 
 
 
699 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.19 
 
 
703 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
690 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1398  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.51 
 
 
710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.27 
 
 
693 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.63 
 
 
706 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.05 
 
 
681 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0405  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.69 
 
 
712 aa  556  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245167  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.9 
 
 
692 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.25 
 
 
711 aa  555  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.52 
 
 
702 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.35 
 
 
680 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.54 
 
 
699 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.62 
 
 
698 aa  548  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 
700 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.02 
 
 
693 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 
700 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 
700 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.2 
 
 
703 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.77 
 
 
697 aa  538  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.51 
 
 
695 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 
707 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.99 
 
 
697 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.25 
 
 
707 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.3 
 
 
698 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.45 
 
 
697 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.55 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.55 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1651  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.51 
 
 
693 aa  530  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0916623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  42 
 
 
697 aa  528  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.63 
 
 
699 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.55 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.55 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.55 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.19 
 
 
699 aa  529  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.1 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.65 
 
 
700 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.55 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.24 
 
 
699 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1484  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.44 
 
 
682 aa  531  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  42 
 
 
699 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  42 
 
 
699 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  42 
 
 
700 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.55 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.14 
 
 
692 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  42.5 
 
 
696 aa  528  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.55 
 
 
709 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.23 
 
 
699 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.27 
 
 
699 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.14 
 
 
699 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.3 
 
 
708 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.34 
 
 
700 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.23 
 
 
699 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.23 
 
 
699 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.34 
 
 
700 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.3 
 
 
708 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.85 
 
 
699 aa  528  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.04 
 
 
699 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.86 
 
 
700 aa  525  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.81 
 
 
699 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>