More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0483 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 261 aa  513  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  50.59 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  46.67 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  38.8 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  39.84 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  36.07 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  33.73 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  33.85 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  35.63 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  33.6 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  35.92 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  38.39 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  32.8 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  31.58 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  33.19 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  31.05 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  31.74 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  30.45 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  34.33 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.8 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  29.37 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  28.85 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  28.74 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  26.69 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.75 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  30.73 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  32.44 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  29.03 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  28.28 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  28.23 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  29.27 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  27.52 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  29.72 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  28.02 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  28.45 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  28.45 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  28.45 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  27.98 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  28.27 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  27.05 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  30.28 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  28.37 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  27.39 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  29.65 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  29.28 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  31.36 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  25.43 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  29.1 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  29.57 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  29.57 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  27.32 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  33.8 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  31.71 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  26.27 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  27.27 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  26.32 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  30.83 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  26.32 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  26.32 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  25.24 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  26.32 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.11 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  28.5 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  28.39 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  27.97 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.25 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  26.67 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  29.54 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  27.2 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  24.8 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  29.44 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0960  flagellar biosynthetic protein FliR  30.13 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  26.75 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>