More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0459 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 370 aa  749    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  49.45 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  46.61 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  46.54 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  44.44 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  46.07 
 
 		 365 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.65 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 		 386 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  45.43 
 
 		 409 aa  298  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  42.78 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.49 
 
 		 359 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  42.7 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.9 
 
 		 371 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  42.7 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  43.14 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  41.58 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.85 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  45.43 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  43.25 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  40.5 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 369 aa  269  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  40.88 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  41.4 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.85 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  39.22 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  45.29 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  38.28 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.71 
 
 		 374 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  37.64 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39.89 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.98 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 367 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  39.34 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  45.28 
 
 		 363 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  38.48 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.32 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  35.08 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  38.48 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  41.27 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  37.18 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.15 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  40.82 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.6 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  38.34 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 360 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.3 
 
 		 369 aa  232  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.83 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  34.53 
 
 		 748 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.34 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.61 
 
 		 365 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  35.64 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  36.57 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  34.97 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  37.53 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  37.63 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  41.92 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  42.61 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36.74 
 
 		 379 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  40.84 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  37.12 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  36.22 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  40.58 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.73 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  41.08 
 
 		 338 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.23 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  40.51 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  40.19 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.75 
 
 		 338 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  38.27 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.72 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  38.75 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.26 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  36.97 
 
 		 385 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  37.53 
 
 		 362 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  36.06 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>