More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0347 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 415 aa  853    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  82.89 
 
 		 415 aa  701    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  63.61 
 
 		 414 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  56.93 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  50.24 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  50.25 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  49.39 
 
 		 409 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  48.54 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  47.28 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  47.45 
 
 		 420 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  45.39 
 
 		 400 aa  356  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  45.14 
 
 		 400 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  46.47 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  45.99 
 
 		 419 aa  348  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  44.17 
 
 		 421 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  44.77 
 
 		 420 aa  346  4e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  44.02 
 
 		 420 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  45.26 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  44.28 
 
 		 420 aa  342  8e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  46.23 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  46.23 
 
 		 414 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  45.81 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  44.47 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  47 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  42.48 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  40.92 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  43.35 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  45.43 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  40.71 
 
 		 404 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  44.69 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  43.72 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  41.36 
 
 		 429 aa  289  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  41.85 
 
 		 419 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  42.2 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  41.62 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  42.65 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  42.34 
 
 		 403 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  36.45 
 
 		 460 aa  271  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  40 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  40.05 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  39.36 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  40.69 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  40 
 
 		 402 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  41.07 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  41.52 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  40 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  40.2 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  37.47 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  30.61 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  34.05 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  32.23 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  29.12 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.74 
 
 		 346 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  29.48 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  28.06 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  30.82 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  26.39 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  33.07 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  28.85 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  27.58 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  25.56 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  28.25 
 
 		 341 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  30.82 
 
 		 341 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  31.98 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  29.75 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  25.07 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  28.07 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  28.65 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  26.83 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  28.99 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.61 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  31.25 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  26.63 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  28.24 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  28.06 
 
 		 342 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  26.86 
 
 		 336 aa  96.3  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4019  6-phosphofructokinase  31.12 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  28.36 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  25.3 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  27.27 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.59 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0140  6-phosphofructokinase  31.36 
 
 		 320 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  29.18 
 
 		 341 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  25.79 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  31.01 
 
 		 320 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  31.91 
 
 		 345 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  32.09 
 
 		 344 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  25.89 
 
 		 345 aa  94  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1999  phosphofructokinase  27.96 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  30.9 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  26.87 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3812  6-phosphofructokinase  30.66 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  28.96 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  28.97 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  36.36 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  26.87 
 
 		 339 aa  90.5  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>