85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0271 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0271  type 3a, cellulose-binding  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.817907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.2 
 
 		 938 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.38 
 
 		 887 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  42.74 
 
 		 671 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.54 
 
 		 1853 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  45.16 
 
 		 857 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.52 
 
 		 919 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.62 
 
 		 985 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  37.17 
 
 		 522 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  36.36 
 
 		 1546 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  39.11 
 
 		 928 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  36.36 
 
 		 2344 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  33.13 
 
 		 1013 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  34.18 
 
 		 1017 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  35.76 
 
 		 1050 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  37.01 
 
 		 1904 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  36.13 
 
 		 1294 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  36.69 
 
 		 949 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  37.29 
 
 		 961 aa  92.8  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1853  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.34 
 
 		 833 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0781355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  34.34 
 
 		 1369 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  32.89 
 
 		 656 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  39.65 
 
 		 1414 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1121 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  34.9 
 
 		 505 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0059  type 3a, cellulose-binding  32.67 
 
 		 486 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  35.26 
 
 		 1759 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 		 678 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 		 728 aa  85.5  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  32.89 
 
 		 763 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  33.56 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  33.79 
 
 		 658 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7202  type 3a cellulose-binding domain protein  35.17 
 
 		 473 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9095  hypothetical protein  29.27 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  30.36 
 
 		 1478 aa  75.9  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 660 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  29.01 
 
 		 1209 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  29.05 
 
 		 619 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 		 1224 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 1137 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  27.27 
 
 		 1298 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.57 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.94 
 
 		 445 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  43.96 
 
 		 555 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  37.25 
 
 		 1281 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  48.39 
 
 		 551 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  26.28 
 
 		 1000 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.44 
 
 		 846 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  56.25 
 
 		 1394 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  43.94 
 
 		 472 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  48.89 
 
 		 830 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  32.41 
 
 		 1217 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0580  hypothetical protein  35.14 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.306305  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  38.16 
 
 		 521 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  54.9 
 
 		 914 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  37.43 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  50.77 
 
 		 433 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  47.92 
 
 		 488 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  34.86 
 
 		 522 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  48.61 
 
 		 456 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  37.5 
 
 		 407 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5165  hypothetical protein  43.84 
 
 		 570 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0452988 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33106  predicted protein  37.93 
 
 		 657 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  43.08 
 
 		 840 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.47 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  54.76 
 
 		 1034 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  50 
 
 		 633 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  47.76 
 
 		 778 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  38.67 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  48.68 
 
 		 202 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  41.46 
 
 		 5993 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4084  PT repeat-containing protein  57.14 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000901223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0069  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.65 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00693904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  33.33 
 
 		 812 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12456  frustulin 5  29.69 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  34.92 
 
 		 630 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2178  hypothetical protein  38.03 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.96347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  50.94 
 
 		 628 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.4 
 
 		 599 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.57 
 
 		 1567 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  45.21 
 
 		 2313 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  51.85 
 
 		 916 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  46.67 
 
 		 2353 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  43.4 
 
 		 489 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30580  alpha-ketoglutarate decarboxylase  36.56 
 
 		 1251 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>