261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0270 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 484 aa  996    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  48.21 
 
 		 372 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  39.12 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  41.9 
 
 		 674 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  41.11 
 
 		 674 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  40.09 
 
 		 674 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  40.18 
 
 		 674 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  41.51 
 
 		 674 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  41.51 
 
 		 674 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  41.51 
 
 		 674 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  41.03 
 
 		 674 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  41.39 
 
 		 674 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  40.42 
 
 		 674 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  40.57 
 
 		 674 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  42.49 
 
 		 652 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 		 904 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  42.71 
 
 		 521 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  37.06 
 
 		 639 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.45 
 
 		 703 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  37.62 
 
 		 652 aa  239  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  33.8 
 
 		 1051 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  40.65 
 
 		 1146 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  34.04 
 
 		 1271 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  41.42 
 
 		 377 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  31.75 
 
 		 997 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  37.12 
 
 		 414 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  40.3 
 
 		 1127 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  40.3 
 
 		 1127 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  40.3 
 
 		 1127 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  40.3 
 
 		 1127 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  37.5 
 
 		 396 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  31.59 
 
 		 760 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  35.88 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  38.86 
 
 		 1129 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  38.4 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  35.16 
 
 		 425 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  38.65 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  38.01 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  39.63 
 
 		 772 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  33.18 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  40.24 
 
 		 855 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  34.16 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  33.09 
 
 		 559 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  38.51 
 
 		 1053 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.43 
 
 		 868 aa  207  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  34.24 
 
 		 867 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  34.26 
 
 		 868 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 1578 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.24 
 
 		 868 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  36.69 
 
 		 763 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 		 868 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  33.75 
 
 		 868 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  37.35 
 
 		 1054 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  33.5 
 
 		 869 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  36.11 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  33.25 
 
 		 398 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  34.59 
 
 		 868 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  32.19 
 
 		 762 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  32.22 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  29.66 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  33.77 
 
 		 463 aa  189  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  32.8 
 
 		 675 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 		 863 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.8 
 
 		 854 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  31.11 
 
 		 657 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  32.41 
 
 		 400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  30.07 
 
 		 634 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  31.99 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1080 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  30.28 
 
 		 848 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  28.06 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  31.07 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  33.25 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 364 aa  167  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  33.51 
 
 		 539 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  30.57 
 
 		 855 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  33.07 
 
 		 532 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.57 
 
 		 792 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.62 
 
 		 848 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  29.17 
 
 		 586 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  32.1 
 
 		 540 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  31.36 
 
 		 651 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  29.18 
 
 		 972 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  32.28 
 
 		 536 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  27.4 
 
 		 499 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  30.83 
 
 		 662 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  33.22 
 
 		 1362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.76 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  34.68 
 
 		 563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 426 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 		 1782 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 		 1246 aa  133  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  29.06 
 
 		 1132 aa  129  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.12 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 		 1443 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  26.01 
 
 		 827 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>