25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0249 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  100 
 
 		 802 aa  1635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  33.52 
 
 		 641 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  29.95 
 
 		 640 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  30.37 
 
 		 624 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  30.67 
 
 		 914 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  31.14 
 
 		 1065 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  28.49 
 
 		 630 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  28.43 
 
 		 623 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  29.14 
 
 		 1011 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  26.46 
 
 		 359 aa  118  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  26.9 
 
 		 748 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  31.2 
 
 		 657 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  27.22 
 
 		 679 aa  103  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  27 
 
 		 766 aa  98.6  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  27.9 
 
 		 1157 aa  97.4  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  26.42 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  27.34 
 
 		 488 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  24.22 
 
 		 522 aa  67.4  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  24.51 
 
 		 1224 aa  63.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  27.35 
 
 		 979 aa  63.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  26.27 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  25.85 
 
 		 399 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1457  hypothetical protein  33.93 
 
 		 904 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  31.53 
 
 		 310 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  24.69 
 
 		 431 aa  45.8  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>