More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0234 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  56.09 
 
 		 552 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  56.54 
 
 		 544 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 843 aa  1757    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  57.93 
 
 		 828 aa  1019    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  61.91 
 
 		 554 aa  750    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  57.69 
 
 		 553 aa  677    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  55.35 
 
 		 560 aa  635  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  56.69 
 
 		 549 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  54.04 
 
 		 549 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  55.13 
 
 		 552 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  54.4 
 
 		 552 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  53.68 
 
 		 549 aa  622  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  51.11 
 
 		 552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  51.02 
 
 		 549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  50.28 
 
 		 550 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  49.35 
 
 		 550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  51.94 
 
 		 548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 		 566 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  50.28 
 
 		 549 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  50.47 
 
 		 547 aa  559  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  52.51 
 
 		 550 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  48.28 
 
 		 566 aa  555  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  49.91 
 
 		 548 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  50.65 
 
 		 549 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  48.1 
 
 		 571 aa  555  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  50.09 
 
 		 549 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  51.21 
 
 		 550 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  48.72 
 
 		 568 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  46.47 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  49.72 
 
 		 549 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  49.42 
 
 		 605 aa  535  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  46.28 
 
 		 565 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  47.93 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  48.11 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  47.78 
 
 		 561 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  47.39 
 
 		 546 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  48.63 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  46.24 
 
 		 564 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  45.34 
 
 		 562 aa  515  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  46.34 
 
 		 557 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  45.8 
 
 		 560 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 		 570 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 		 576 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 		 576 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  46.69 
 
 		 552 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 		 576 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 		 576 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 		 576 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  45.52 
 
 		 560 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 		 576 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  46.81 
 
 		 564 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  48 
 
 		 563 aa  511  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  46.53 
 
 		 562 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  45.54 
 
 		 578 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  45.7 
 
 		 560 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  46.89 
 
 		 576 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  45.49 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  45.86 
 
 		 560 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  45.4 
 
 		 564 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  45.88 
 
 		 557 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  45.21 
 
 		 544 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  45.72 
 
 		 576 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  45.54 
 
 		 564 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  44.35 
 
 		 576 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  45.69 
 
 		 557 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  49.34 
 
 		 605 aa  501  1e-140  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  45.52 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  45.59 
 
 		 565 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  43.78 
 
 		 571 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  47.53 
 
 		 542 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  44.89 
 
 		 576 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  44.5 
 
 		 560 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  45.59 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  45.78 
 
 		 538 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  45.07 
 
 		 576 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  45.59 
 
 		 540 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  45.47 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  45.59 
 
 		 540 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  44.2 
 
 		 538 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  44.5 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  43.96 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  43.08 
 
 		 571 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  42.56 
 
 		 571 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  44.14 
 
 		 546 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  45.96 
 
 		 577 aa  489  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  42.37 
 
 		 1043 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  44.57 
 
 		 579 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  42.73 
 
 		 579 aa  486  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  44.59 
 
 		 562 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  43.59 
 
 		 575 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  46.13 
 
 		 572 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  43.45 
 
 		 601 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  44.22 
 
 		 575 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  43.85 
 
 		 575 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  44.16 
 
 		 570 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  44.53 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  43.85 
 
 		 575 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  43.95 
 
 		 574 aa  482  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  45.64 
 
 		 577 aa  481  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  43.45 
 
 		 578 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>