More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0212 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  100 
 
 		 471 aa  963    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  55.7 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  55.28 
 
 		 451 aa  527  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  52.58 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  52.57 
 
 		 458 aa  494  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  52.43 
 
 		 446 aa  488  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  51.99 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  50 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  51.78 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  49.89 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  50.33 
 
 		 452 aa  458  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  48.28 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  50.79 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  46.53 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  48.25 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  48.03 
 
 		 488 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  46.56 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  47.53 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  43.59 
 
 		 478 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  46.76 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  45.66 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  44.84 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  46.88 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  44.64 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  47.66 
 
 		 439 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  45.57 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  46.81 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  43.75 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  45.17 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  44.64 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  44.54 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  43.56 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  47.54 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  43.82 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  42.24 
 
 		 476 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  42.98 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  42.49 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  43.1 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  44.78 
 
 		 474 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  43.25 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  43.38 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  43.08 
 
 		 468 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  43.43 
 
 		 455 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  44.73 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  45.32 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  42.38 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  43.98 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  46.36 
 
 		 437 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  43.21 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  43.4 
 
 		 489 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  43.34 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  46.17 
 
 		 482 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  43.75 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  45.49 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  45.85 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  44.75 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  44.89 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  41.89 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  41.72 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  43.1 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  43.02 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  43.27 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  43.38 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  42.89 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  41.24 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  42.83 
 
 		 479 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  43.5 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  42.34 
 
 		 440 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  42.56 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  42.34 
 
 		 450 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  41.47 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  42.92 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  42.79 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  39.29 
 
 		 491 aa  372  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  41.93 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  43.69 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  42.64 
 
 		 909 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  44.42 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  41.14 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  41.34 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  42.98 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  41.69 
 
 		 455 aa  362  6e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  40.91 
 
 		 461 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  41.85 
 
 		 444 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  43.5 
 
 		 467 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  38.31 
 
 		 465 aa  359  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  41.89 
 
 		 457 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  40.22 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  42.76 
 
 		 473 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  42.12 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  42.31 
 
 		 468 aa  353  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  41.59 
 
 		 453 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  40.09 
 
 		 440 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  41.8 
 
 		 457 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  39.95 
 
 		 450 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  41.01 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  40.71 
 
 		 451 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  40.69 
 
 		 469 aa  349  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  41.13 
 
 		 479 aa  349  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  41.15 
 
 		 451 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>