189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0211 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
334 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
269 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  41.07 
 
 
277 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  34.29 
 
 
268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  33.73 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  44.85 
 
 
345 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 
260 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  36.48 
 
 
272 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  33.47 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  30.99 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  30.52 
 
 
260 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  46.88 
 
 
736 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  53.42 
 
 
599 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.69 
 
 
582 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  61.9 
 
 
611 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  51.04 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  47.92 
 
 
591 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  30.14 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  41.28 
 
 
563 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 
593 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  58.73 
 
 
571 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  42.24 
 
 
600 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  53.12 
 
 
484 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.13 
 
 
842 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  44.44 
 
 
922 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  53.62 
 
 
649 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  35.62 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  48.05 
 
 
773 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  40.38 
 
 
526 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
619 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  45.24 
 
 
554 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  50.6 
 
 
831 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  49.33 
 
 
948 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  27.78 
 
 
435 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  43.3 
 
 
707 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  51.67 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  43.16 
 
 
739 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  53.97 
 
 
814 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  49.33 
 
 
820 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  53.97 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  53.33 
 
 
630 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  52.38 
 
 
928 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  55.74 
 
 
533 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.93 
 
 
528 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
730 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  27.57 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  53.45 
 
 
501 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  47.62 
 
 
965 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  53.12 
 
 
928 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.33 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 
741 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  43.48 
 
 
524 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  48.39 
 
 
951 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  41.86 
 
 
1077 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  51.56 
 
 
961 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  44.33 
 
 
683 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  49.21 
 
 
789 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  50.77 
 
 
533 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.03 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  51.56 
 
 
660 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  49.25 
 
 
982 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  30.16 
 
 
423 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  28.07 
 
 
475 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 
475 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  45.57 
 
 
895 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
837 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 
427 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  44.44 
 
 
900 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.44 
 
 
790 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 
467 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  46.03 
 
 
742 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  47.69 
 
 
639 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.33 
 
 
411 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  28.68 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 
563 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  42.65 
 
 
490 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  43.75 
 
 
532 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  46.03 
 
 
566 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  30.69 
 
 
289 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  47.69 
 
 
679 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 
509 aa  59.7  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.48 
 
 
1209 aa  59.3  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05790  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  26.2 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  41.25 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 
710 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  29.58 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  29.01 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  40 
 
 
710 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.44 
 
 
511 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  49.21 
 
 
425 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
608 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.07 
 
 
907 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 
492 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.83 
 
 
537 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  43.84 
 
 
580 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  48.48 
 
 
848 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  44.83 
 
 
535 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  38.36 
 
 
477 aa  55.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  34.26 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>