More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0158 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  100 
 
 		 497 aa  1008    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  65.64 
 
 		 494 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  55.44 
 
 		 564 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  52.67 
 
 		 559 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  57.82 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  49.28 
 
 		 562 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  46.8 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  46.33 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  47 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  46.79 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  43.43 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  45.83 
 
 		 530 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  45.56 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  42.83 
 
 		 492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  45.27 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  44.91 
 
 		 507 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  42.53 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  41.23 
 
 		 487 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  46.38 
 
 		 489 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  41.6 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  41.6 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  41.6 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  42.91 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  39.72 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  41.6 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  39.72 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  41.6 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  41.18 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  47.23 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  40.71 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  41.18 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  40.5 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  42.35 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  41.6 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  42.14 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  39.84 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  41.72 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  40.76 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  41.18 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  42.28 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  47.22 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  40.55 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  42.07 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  40.55 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  41.09 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  40.55 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  42.07 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  42.25 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  41.4 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  40.82 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  42.25 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  41.86 
 
 		 502 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  41.65 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  41.86 
 
 		 502 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  41.83 
 
 		 500 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  39.79 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  39.43 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  41.65 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  41.65 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  39.43 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  39.43 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  41.65 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  40.76 
 
 		 489 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  40.93 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.51 
 
 		 543 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  40.88 
 
 		 493 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  41.61 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  40.82 
 
 		 490 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  43.43 
 
 		 493 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  41.09 
 
 		 489 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  39.67 
 
 		 496 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  41.07 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  41.19 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  39.84 
 
 		 515 aa  358  9e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  44.01 
 
 		 1007 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  40.55 
 
 		 484 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  41.63 
 
 		 483 aa  356  5.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  40.12 
 
 		 485 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  44.55 
 
 		 908 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  39.92 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  37.9 
 
 		 525 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  38.81 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  43.96 
 
 		 702 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  41.09 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  41.35 
 
 		 490 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  37.65 
 
 		 491 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  44.1 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  36.55 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  45.48 
 
 		 990 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  41.13 
 
 		 504 aa  349  7e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  40.58 
 
 		 491 aa  349  7e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  37.01 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>