More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0152 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0152  aldo/keto reductase  100 
 
 
315 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.145765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0774  aldo/keto reductase  58.92 
 
 
315 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  53.82 
 
 
315 aa  357  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2266  aldo/keto reductase  50.49 
 
 
317 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000706888 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  50.48 
 
 
315 aa  333  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0914  aldo/keto reductase  48.57 
 
 
316 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.288271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  45.08 
 
 
315 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
316 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1718  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
316 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1437  aldo/keto reductase  40.63 
 
 
316 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0964  aldo/keto reductase  42.54 
 
 
337 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000631386  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1727  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.14 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  29.13 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  27.71 
 
 
337 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  31.27 
 
 
365 aa  99.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.74 
 
 
350 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  29.13 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  27.42 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  28.03 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  28.78 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  24.38 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  24.38 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  30.05 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  26.2 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  25.53 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  27.2 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  25.74 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  25 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  25 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  29.28 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  24.59 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  27.88 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  32.12 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  24.25 
 
 
379 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  31.29 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  28.87 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  26.91 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  27.8 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  24.76 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  28.73 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  25.21 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  27.39 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  26.79 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  27.93 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  24.89 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  29.06 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  27.08 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  26.06 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  25.84 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  24.27 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  25.55 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3770  aldo/keto reductase  26.56 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.730632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  26.79 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  28.96 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  27.09 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  22.83 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  28.96 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  27.85 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.37 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  29.61 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  24.52 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3357  aldo/keto reductase  29.63 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  28.75 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  28.02 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  31.58 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  29.27 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  25.89 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.02 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0309  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  26.94 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  29.89 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  26.99 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0534  aldo/keto reductase  25.71 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  32.1 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  26.34 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.63 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  30.59 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  26.45 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1182  aldo/keto reductase  23.72 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  29.17 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  29.44 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.02 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.02 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  27.57 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.02 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1447  aldo/keto reductase  27.9 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  26.76 
 
 
408 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.47 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  27.12 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  29.17 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  27.47 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  29.81 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.02 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  28.74 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>