48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0144 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0144  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 		 83 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000227972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2253  preprotein translocase, SecG subunit  73.97 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2112  preprotein translocase, SecG subunit  67.27 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.845605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1311  preprotein translocase subunit SecG  47.37 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.199166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2986  preprotein translocase subunit SecG  58.82 
 
 		 76 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000752788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2957  preprotein translocase subunit SecG  55.71 
 
 		 77 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000890053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2014  protein translocase subunit secG  60 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3932  preprotein translocase subunit SecG  55.88 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000065987  normal  0.782287 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0307  preprotein translocase subunit SecG  56.92 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2867  preprotein translocase, SecG subunit  45.71 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3127  preprotein translocase subunit SecG  49.3 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4923  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5245  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15770  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000937374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  49.23 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  49.23 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5707  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00561728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  49.23 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  49.23 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  49.23 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  49.23 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  49.23 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3675  preprotein translocase subunit SecG  49.23 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000427744  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0803  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00307669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0819  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.538835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0448  preprotein translocase subunit SecG  44.78 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0277  preprotein translocase subunit SecG  46.48 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000034073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1613  preprotein translocase, SecG subunit  47.54 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0271  preprotein translocase subunit SecG  45.07 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000402073  normal  0.880463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1949  preprotein translocase subunit SecG  47.95 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000015904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2058  preprotein translocase subunit SecG  45.71 
 
 		 134 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4714  preprotein translocase, SecG subunit  45.71 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1627  preprotein translocase subunit SecG  45.21 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0003761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1503  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000422851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1293  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000521204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2058  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.753459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  37.5 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1881  preprotein translocase subunit SecG  42.47 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2339  preprotein translocase subunit SecG  41.1 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000342289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1696  preprotein translocase subunit SecG  42.47 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000318284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1334  preprotein translocase, SecG subunit  41.79 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.6051400000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1902  protein translocase subunit secG  37.5 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  35 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0349  preprotein translocase subunit SecG  35.44 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1619  preprotein translocase subunit SecG  38.36 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000330295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4183  preprotein translocase subunit SecG  33.75 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  33.75 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  37.66 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>