91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0122 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0122  SpoVA protein  100 
 
 
147 aa  292  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.385931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2282  stage V sporulation protein AC  63.01 
 
 
147 aa  200  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2304  stage V sporulation protein AC  57.97 
 
 
155 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1561  SpoVA protein  56.03 
 
 
148 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2731  stage V sporulation protein AC  53.79 
 
 
152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3439  stage V sporulation protein AC  57.34 
 
 
155 aa  153  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2019  stage V sporulation protein AC  57.25 
 
 
155 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1248  stage V sporulation protein AC  48.23 
 
 
161 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1376  SpoVA protein  50.34 
 
 
170 aa  145  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0626  spore formation protein spoVAC  50 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1106  SpoVA protein  47.86 
 
 
151 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07050  Sporulation stage V protein AC  43.8 
 
 
149 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1222  SpoVA protein  46.15 
 
 
153 aa  140  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000481736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1659  stage V sporulation protein AC  47.79 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.493863  normal  0.375555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0479  stage V sporulation protein AC  41.43 
 
 
167 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1465  SpoVA protein  44.29 
 
 
159 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0788  stage V sporulation protein AC  42.14 
 
 
159 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2381  stage V sporulation protein AC  41.96 
 
 
149 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0720  stage V sporulation protein AC  36.99 
 
 
157 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1743  stage V sporulation protein AC  38.73 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4939  sporulation stage V protein AC  37.86 
 
 
158 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5249  stage V sporulation protein AC  37.86 
 
 
158 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3688  sporulation stage V protein AC  37.14 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2767  sporulation stage V protein AC  39.04 
 
 
150 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.428102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5265  SpoVA family protein  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5692  SpoVA family protein  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5231  SpoVA family protein  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4995  stage V sporulation protein AC  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0208  SpoVA family protein  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4824  stage V sporulation protein AC  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4839  stage V sporulation protein AC  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0227  SpoVA family protein  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5375  stage v sporulation protein ac  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5307  SpoVA family protein  37.86 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3825  stage V sporulation protein AC  40.14 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1654  stage V sporulation protein AC  37.86 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4177  SpoVA family protein  37.16 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0136798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1061  SpoVA family protein  37.16 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0415842  normal  0.102128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4137  stage V sporulation protein AC  38.73 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0686624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4200  SpoVA family protein  38.73 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000132826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3979  stage V sporulation protein AC  38.73 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4089  SpoVA family protein  38.73 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000123549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3809  stage V sporulation protein AC  38.73 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.403654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4289  stage v sporulation protein ac  38.73 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3898  sporulation stage V protein AC  35.14 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.373295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2247  SpoVA protein  34.04 
 
 
145 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0377  SpoVA protein  31.47 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0722  stage V sporulation protein AE  48.86 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0790  stage V sporulation protein AE  38.46 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1656  stage V sporulation protein AE  36.51 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3690  sporulation stage V protein AE  36.13 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2765  sporulation stage V protein AE  37.76 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.60711  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0229  SpoVA family protein  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5251  stage V sporulation protein AE, truncation  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4997  stage V sporulation protein AE  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4826  stage V sporulation protein AE  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4841  stage V sporulation protein AE  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5377  stage V sporulation protein AE  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0206  SpoVA family protein  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5233  SpoVA family protein  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4941  sporulation stage V protein AE  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5690  SpoVA family protein  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5309  SpoVA family protein  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5267  SpoVA family protein  36.97 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4175  stage V sporulation protein AE  32.74 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1463  SpoVA protein  39.17 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2379  stage V sporulation protein AE  41.86 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.134026  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1063  stage V sporulation protein AE  32.74 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2198  normal  0.21703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1741  stage V sporulation protein AE  39.78 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2733  stage V sporulation protein AE  39.02 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4087  stage V sporulation protein AE  31.86 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000720162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4198  stage V sporulation protein AE  31.86 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000578449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3977  stage V sporulation protein AE  31.86 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3807  stage V sporulation protein AE, N-terminal region  31.86 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3823  stage V sporulation protein AE, N-terminal region  31.86 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3896  sporulation stage V protein AE  33.04 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.18857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1657  stage V sporulation protein AE  32.76 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.449041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3437  stage V sporulation protein AE  32.58 
 
 
120 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2245  SpoVA protein  32.74 
 
 
116 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0379  SpoVA protein  32.17 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1246  stage V sporulation protein AE  30 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1108  SpoVA protein  31.87 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1563  SpoVA protein  28.93 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.807903  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2017  stage V sporulation protein AE  31.52 
 
 
121 aa  48.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2302  stage V sporulation protein AE  31.52 
 
 
121 aa  48.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1220  SpoVA protein  34.15 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000192439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07070  Sporulation stage V protein AE  37.5 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0124  SpoVA protein  31.58 
 
 
118 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00762492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1374  SpoVA protein  30.49 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.523405  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0481  stage V sporulation protein AE  32.43 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2280  stage V sporulation protein AE  35.14 
 
 
118 aa  40  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>