More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0119 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  100 
 
 		 149 aa  303  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  70.21 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  58.7 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  58.7 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  59.7 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  58.16 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  54.86 
 
 		 146 aa  166  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  56.2 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  51.39 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  54.74 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  52.08 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  57.14 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  58.45 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  50.74 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  49.28 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  49.66 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  49.28 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  48.23 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  43.57 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48.55 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  31.11 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  29.41 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.2 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  25.53 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  25.53 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  30.15 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  30.15 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  40 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.12 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  24.82 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  25.53 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  24.82 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  24.82 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  24.82 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  24.82 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  24.11 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  24.11 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1473  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  33.06 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00187817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.24 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.24 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1812  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 588 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 		 630 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1291  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  27.2 
 
 		 310 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3799  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000337486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3439  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  32.69 
 
 		 307 aa  50.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  32.38 
 
 		 501 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1749  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3742  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  28 
 
 		 457 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0764  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 568 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2146  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1673  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 644 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 403 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0339  histidine kinase  30.47 
 
 		 408 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 922 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  30.17 
 
 		 586 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 340 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 540 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 340 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 340 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  39.68 
 
 		 313 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 250 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  33.88 
 
 		 340 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 340 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 340 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 340 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 905 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 340 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  31 
 
 		 420 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  27.15 
 
 		 458 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0867  ATPase domain-containing protein  31.13 
 
 		 632 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>