More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0105 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  53.46 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 		 226 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  53.39 
 
 		 217 aa  237  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  52.29 
 
 		 215 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  52.73 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  55.67 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  51.61 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  50.22 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.39 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  48.39 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  50.69 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  49.08 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  52.07 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  52.94 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  47.66 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  49.22 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  50.78 
 
 		 202 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  42.66 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  49.54 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  42.66 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.24 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  42.01 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  47.4 
 
 		 204 aa  194  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.01 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  45.62 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  47.42 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  43.58 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  42.47 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 205 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  41.28 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  47.69 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 199 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  44.7 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.36 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  43.32 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  45.89 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  45.25 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  46.97 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45.62 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  47.21 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  46.67 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  45.54 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  41.28 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  51.04 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  42.01 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>