175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0098 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0098  peptidase M50  100 
 
 
269 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2547  peptidase M50  33.08 
 
 
301 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000136347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  25.19 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  24.22 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  26.42 
 
 
285 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2124  peptidase M50  28.74 
 
 
284 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000917211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  25.1 
 
 
302 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  23.44 
 
 
292 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  23.74 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2389  M50 family peptidase  27.48 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4342  peptidase M50  23.35 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2101  M50 family peptidase  27.31 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00808635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  24.64 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0549  peptidase M50  25.65 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00818515  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  27.98 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  27.22 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  25.51 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  30.94 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  31.25 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  31.25 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  26.74 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  26.16 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  30.56 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  29.86 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  30.56 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  29.79 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  29.73 
 
 
412 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  29.86 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  26.92 
 
 
383 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  29.86 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  28.28 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  29.17 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  29.27 
 
 
373 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  29.24 
 
 
373 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  27.64 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  24.38 
 
 
375 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  22.22 
 
 
390 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  23.83 
 
 
376 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  25.09 
 
 
338 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  25.19 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  30.47 
 
 
397 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  24.84 
 
 
372 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3161  peptidase M50  25.75 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000495345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  24.26 
 
 
415 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  23.66 
 
 
370 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  28.92 
 
 
374 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  26.62 
 
 
370 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  23.26 
 
 
394 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  23.04 
 
 
393 aa  58.9  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  25.35 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  26.97 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  28.76 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  28.47 
 
 
374 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  28.47 
 
 
374 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  29.69 
 
 
396 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  27.33 
 
 
370 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  27.05 
 
 
386 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  28 
 
 
380 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  25.44 
 
 
384 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  31.03 
 
 
373 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  27.44 
 
 
361 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  28.86 
 
 
380 aa  55.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  28.28 
 
 
413 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  26.67 
 
 
371 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  28.86 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  31.62 
 
 
383 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  27.45 
 
 
424 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  25.89 
 
 
380 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  26.42 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  27.38 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  25.9 
 
 
375 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  23.6 
 
 
377 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  24.58 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  24.26 
 
 
364 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  30.43 
 
 
380 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  26.52 
 
 
372 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3157  peptidase M50  25.99 
 
 
382 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  26.52 
 
 
366 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0907  peptidase M50  21.01 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  24.67 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  25.41 
 
 
370 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  25.71 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  25.71 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  26.67 
 
 
387 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  26.96 
 
 
362 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  24.79 
 
 
379 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  27.01 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  36.67 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2543  peptidase M50  29 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  30.17 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2308  peptidase M50  35.23 
 
 
385 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  30.3 
 
 
394 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  20.86 
 
 
373 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  28.21 
 
 
379 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  40.3 
 
 
226 aa  50.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  28.09 
 
 
207 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  26.23 
 
 
362 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  25 
 
 
377 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  26.17 
 
 
388 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>