More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0097 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  100 
 
 		 291 aa  591  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  40.83 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  47.15 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.33 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.34 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  31.85 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  47.5 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  36.16 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  47.5 
 
 		 350 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44.35 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  47.62 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  30.33 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  34.78 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  31.86 
 
 		 430 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  40.67 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  33.86 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  43.85 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  43.55 
 
 		 404 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.74 
 
 		 431 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  45.53 
 
 		 379 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.7 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  32.72 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  28.88 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.19 
 
 		 751 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  44.72 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  47.11 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  45.24 
 
 		 727 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  45.24 
 
 		 727 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.62 
 
 		 404 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  40.88 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  39.06 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  40.88 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.4 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  46.4 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  40.15 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  44.83 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  45.97 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  47.58 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  41.38 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  41.38 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  37.5 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  41.35 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  28.63 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  39.49 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  43.8 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  41.79 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  37.58 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  46.77 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  41.32 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  35.03 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  44.03 
 
 		 195 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  39.74 
 
 		 427 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  39.74 
 
 		 427 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  41.91 
 
 		 419 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  39.13 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  35.33 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  43.55 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  39.29 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  38.89 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.32 
 
 		 442 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  43.2 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  43.69 
 
 		 446 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  40.8 
 
 		 452 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  38.89 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  36.72 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  34.27 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  36.72 
 
 		 238 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  46.49 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  46.96 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  42.97 
 
 		 590 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  36.43 
 
 		 430 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  47.96 
 
 		 446 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.52 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.98 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  43.8 
 
 		 448 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  45.13 
 
 		 379 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  39.74 
 
 		 438 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  34.02 
 
 		 394 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41.35 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.46 
 
 		 527 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  38.4 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  41.6 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  34.78 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  37.33 
 
 		 216 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  42.72 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  41.6 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  42.72 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.06 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  43.86 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  42.02 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  36.88 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  38.24 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  32.24 
 
 		 303 aa  99  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  42.97 
 
 		 824 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  44.25 
 
 		 374 aa  99.4  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  39.37 
 
 		 406 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.8 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.92 
 
 		 423 aa  99  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  47.27 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  38.71 
 
 		 457 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>