35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0085 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0085  negative regulator of genetic competence  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2566  Negative regulator of genetic competence  54.33 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1712  Negative regulator of genetic competence  32.87 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0444  adaptor protein  28.37 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3800  adaptor protein  29.72 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000607064  hitchhiker  0.000000000000878856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1213  adaptor protein  29.81 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000472996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1616  adaptor protein  29.81 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000116418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1651  adaptor protein  29.81 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000117003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1584  adaptor protein  29.81 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3725299999999996e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1510  adaptor protein  29.81 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000470165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1372  adaptor protein  29.81 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000504302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1400  adaptor protein  29.81 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1371  adaptor protein  29.81 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1545  adaptor protein  29.72 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00170142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2184  adaptor protein  27.88 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1412  adaptor protein  29.81 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000280861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4102  Negative regulator of genetic competence  28.5 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000186936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3752  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  25.86 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000704019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1620  adaptor protein  28.63 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1703  adaptor protein  27.5 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.732057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0765  adaptor protein  27.78 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0568  adaptor protein  25.33 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1976  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  26.38 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.724291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0564  negative regulator of genetic competence sporulation and motility-like protein  20.99 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0906  adaptor protein  25.75 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1358  adaptor protein  20.43 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00058732  normal  0.0135974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1349  adaptor protein  24.79 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.281114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4097  adaptor protein  24.79 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1273  adaptor protein  24.79 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1087  adaptor protein  24.79 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.730074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1093  adaptor protein  24.79 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1111  adaptor protein  24.79 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1311  adaptor protein  24.79 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1244  adaptor protein  24.79 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1162  negative regulator of genetic competence, sporulation and motility  24.1 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>