More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0070 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  64.67 
 
 
467 aa  653    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
463 aa  730    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  65.8 
 
 
462 aa  655    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
463 aa  731    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
463 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
463 aa  731    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
463 aa  731    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  71.34 
 
 
472 aa  714    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 
463 aa  731    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2823  asparaginyl-tRNA synthetase  70.56 
 
 
465 aa  717    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  67.24 
 
 
467 aa  672    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2509  asparaginyl-tRNA synthetase  70.56 
 
 
465 aa  717    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  72.2 
 
 
463 aa  728    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  71.77 
 
 
463 aa  724    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  73.92 
 
 
463 aa  732    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  77.16 
 
 
464 aa  767    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
464 aa  961    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  72.63 
 
 
463 aa  729    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  76.08 
 
 
463 aa  763    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  73.06 
 
 
463 aa  733    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  62.53 
 
 
460 aa  611  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 
463 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  63.76 
 
 
461 aa  601  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  63.31 
 
 
461 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 
463 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2729  asparaginyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 
463 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 
463 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 
461 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 
463 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2958  asparaginyl-tRNA synthetase  63.98 
 
 
461 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000035499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2412  asparaginyl-tRNA synthetase  63.84 
 
 
461 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000151025  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  61.74 
 
 
463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3649  asparaginyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 
463 aa  584  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 
467 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
464 aa  578  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0586  asparaginyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 
468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551773  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1958  asparaginyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 
466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000380108  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 
462 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 
466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 
461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 
466 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2362  asparaginyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
466 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000563375  hitchhiker  0.00208401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 
466 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  59.57 
 
 
503 aa  569  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0756  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
467 aa  568  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2128  asparaginyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 
466 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132176  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2204  asparaginyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 
466 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000142874  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 
462 aa  571  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  60.75 
 
 
466 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 
461 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1900  asparaginyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 
466 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000597558  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1803  asparaginyl-tRNA synthetase  58.55 
 
 
466 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000542712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
466 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 
471 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
466 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
466 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  61.06 
 
 
466 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1719  asparaginyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 
463 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00602659  normal  0.38448 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 
467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 
467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2379  asparaginyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 
466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000851779  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0260  asparaginyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2169  asparaginyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 
466 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 
466 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 
466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1914  asparaginyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 
466 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000157072  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3019  asparaginyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 
482 aa  558  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.852561  hitchhiker  0.00877585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
466 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
466 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
466 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1706  asparaginyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 
459 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00283051  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  60.18 
 
 
466 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 
466 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 
473 aa  553  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 
466 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 
466 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0689  asparaginyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
456 aa  551  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.881016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4810  asparaginyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 
466 aa  554  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 
466 aa  554  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
479 aa  551  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
466 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1449  asparaginyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 
466 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 
475 aa  551  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 
472 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
465 aa  547  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 
466 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
465 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>