78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0063 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.96 
 
 		 111 aa  157  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1259  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.93 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.790235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  38.02 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.06 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.66 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  40.78 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  37.21 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  34.34 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  34.34 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  34.34 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  37.21 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  34.34 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  34 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  30.63 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  56.41 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  62.07 
 
 		 884 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  56.76 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  48.57 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  51.43 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.78 
 
 		 520 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  33.66 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  45.95 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  50 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  51.72 
 
 		 501 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  45.71 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  69.57 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  39.06 
 
 		 878 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  51.52 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  58.82 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  51.52 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  51.52 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  53.12 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  51.52 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  57.58 
 
 		 36 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  45.71 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  42.86 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  51.52 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1856  ruberythrin-like  44.12 
 
 		 39 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  47.06 
 
 		 194 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  37.5 
 
 		 878 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  51.43 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3363  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  42.86 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  72.73 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  47.06 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  63.64 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  51.72 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  48.39 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  47.06 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  59.09 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  55.17 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  63.64 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  43.24 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  47.06 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.88 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  47.06 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  50 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  50 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2780  rubrerythrin  50 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.588149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  50 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0238  hypothetical protein  45.24 
 
 		 47 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  44.44 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  42.86 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.74 
 
 		 589 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  43.75 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  40 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  48.65 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  41.18 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  48.65 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  50 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  47.06 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  42.42 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  56.25 
 
 		 202 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  46.67 
 
 		 168 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  50 
 
 		 177 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  65.22 
 
 		 195 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  42.86 
 
 		 190 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>