More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0060 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  347  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2572  hypothetical protein  54.14 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000165851  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  43.64 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2930  hypothetical protein  42.31 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2613  hypothetical protein  42.31 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  48.08 
 
 		 848 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  28.99 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  44.59 
 
 		 384 aa  57.8  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  48 
 
 		 897 aa  57.8  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  92.31 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  38.03 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  87.5 
 
 		 593 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  87.5 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  87.5 
 
 		 866 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  45.76 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  90.91 
 
 		 420 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  28.31 
 
 		 896 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 837 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  90.91 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  35.05 
 
 		 888 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 864 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1443  hypothetical protein  36.71 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000387012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  38.96 
 
 		 276 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  95.45 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0722  SecC motif-containing protein  72.41 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5550  SEC-C motif domain protein  38.1 
 
 		 296 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  38.96 
 
 		 276 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  76.92 
 
 		 830 aa  52  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  57.14 
 
 		 1136 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  90.91 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  63.64 
 
 		 921 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 921 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  51.85 
 
 		 845 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  51.02 
 
 		 836 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 910 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  40.62 
 
 		 800 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 894 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 834 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 844 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 858 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  48.89 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  90.48 
 
 		 535 aa  50.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  38.04 
 
 		 432 aa  50.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  90.91 
 
 		 993 aa  50.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  34.88 
 
 		 237 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  34.88 
 
 		 267 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 859 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  66.67 
 
 		 421 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  51.22 
 
 		 1029 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 838 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  95 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  54.29 
 
 		 419 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  80 
 
 		 259 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  78.26 
 
 		 1200 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003841  hypothetical protein  63.64 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0625372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  31.08 
 
 		 872 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  48.84 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  95 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  90 
 
 		 585 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 922 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  34.18 
 
 		 897 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  82.61 
 
 		 239 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  33.75 
 
 		 897 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  34.15 
 
 		 900 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 957 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2278  hypothetical protein  55 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  95.24 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 958 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  51.16 
 
 		 910 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0959  SEC-C motif domain protein  76.92 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.510797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  66.67 
 
 		 909 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3769  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00054409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  90.48 
 
 		 257 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 912 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3289  SEC-C motif domain protein  76.92 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  53.33 
 
 		 904 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0182  SecC motif-containing protein  80 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 896 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1113  SecC motif-containing protein  43.08 
 
 		 618 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1603  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 291 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0528578 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  53.33 
 
 		 904 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1315  SecC motif-containing protein  95.24 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.492194  hitchhiker  0.0000960834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  53.33 
 
 		 904 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 902 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1913  SEC-C motif domain protein  80.95 
 
 		 291 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1631  SecC motif-containing protein  80.95 
 
 		 291 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783853  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  40.98 
 
 		 896 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  69.23 
 
 		 61 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2565  SEC-C motif domain protein  82.61 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  82.61 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  62.07 
 
 		 980 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  82.61 
 
 		 899 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  60 
 
 		 909 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  85 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  94.74 
 
 		 278 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  41.18 
 
 		 110 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  94.74 
 
 		 731 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  85.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 833 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>